渤海湾是一个半封闭的淤泥质浅水海湾,与外海的水交换能力较弱。随着沿海经济的快速发展和近岸排污量的增加,水体富营养化和赤潮灾害频发等海洋水生态环境问题日趋明显。近岸海域水生态环境特性及模拟方法的研究,对认识海洋生态过程、保护近岸海洋生态系统和海洋管理有重要的意义。由于水生态环境的高度复杂性、非线性和时空特异性,系统的内部作用机理及其动态变化过程还未被完全知晓,使得单纯用传统的基于机理或假设的确定性水生态动力学模型方法受到了限制。随着包括遥感在内的海洋生态环境数据信息量的飞快增加,越来越多的信息学技术被应用于水生态环境的研究中。本文利用现代水信息技术,系统地研究了近岸海域水生态环境的特性及建模方法。本文首先分析了近岸海域水生态环境的特性及模拟研究中需要解决的问题:如何有效地提取出海量数据中潜在有用的信息和知识;如何准确地分析水生态环境的空间特性;如何有效地模拟水生态环境的高度复杂性和非线性关系;如何在动态演变中体现出空间异质性和局部相互作用的影响;如何有效地耦合水动力学模型和生态模型。其次,利用数据挖掘方法和空间数据分析方法对渤海湾水生态环境特性进行了分析。聚类分析、关联分析和决策树分析提取出了渤海湾水生态环境中一些潜在的知识;空间自相关和空间自回归分析的研究表明渤海湾各生态环境指标具有高度的正空间自相关性,同时发掘了渤海湾赤潮前后的一些特性及异常现象。然后利用非确定性的软计算方法研究近岸海域水生态系统的高度复杂性和非线性关系,建立了基于混合软计算方法的生态模型Eco_HSC,研究表明该模型能较好地反映出各站位叶绿素a浓度实测值的变化趋势,并具有较强的泛化能力;利用元胞自动机(CA)的局部网格动力学优势,综合考虑了局部作用、空间差异和外在因子的影响,建立了基于CA-SVM的渤海湾遥感叶绿素浓度模型,研究表明该模型总体上能较好地反映出渤海湾空间上叶绿素浓度的时空变化特征。最后,探讨了确定性方法与非确定性方法的结合。通过将水动力学模块的模拟结果引入到的CA-SVM生态模块中,建立了渤海湾的生态和水动力学耦合模型,研究表明该模型能很好地模拟渤海湾遥感叶绿素浓度的时空变化特征。