20世纪60年代以来，学者们在研究国际贸易时发现，国家之间在出口某类产品的同时，还进口此类产品，这种新现象是传统的国际贸易理论无法解释的，学者们把其定义为产业内贸易。学者们的研究也表明，我国农产品贸易存在着产业内贸易。我国是一个农业大国，农产品的生产和贸易对我经济的发展起着重要的作用。加入WTO以后，我国农业在世界上面临更加激烈的竞争，而发展农产品产业内贸易成为可持续发展的现实选择。我国农产品产业内贸易的规模如何、发展趋势怎样、主要受到哪些因素的影响，研究这些问题有助于发现我国农产品对外贸易的规律，也有助于对我国农产品对外贸易进行准确的定位。因此，笔者选择了我国农产品产业内贸易研究这个题目。本文坚持理论分析和实证分析相结合、定量分析和定性分析相结合、指标分析和计量分析相结合的原则，在系统地梳理了相关理论的基础上，首先选择了GL指数、Brülhart边际产业内贸易指数和Thom&McDowell指数，借助现有的统计数据，对2000年到2010年的我国农产品整体的产业内贸易的水平、结构和发展趋势作了全面的分析，另外，本文还选择了美国、日本、韩国和巴西这四个重要的农产品贸易伙伴进行了双边的产业内贸易水平、结构和发展趋势的分析。在此基础上，本文从供给方面、需求方面和其他方面着手，选择了七个影响因素分别对无加权的GL指数、加权的GL指数、水平产业内贸易指数和垂直产业内贸易指数进行面板数据的回归分析。本文的研究结果表明我国农产品产业内贸易与产业间贸易并存，产业内贸易水平比较低，产业内贸易占主导地位的农产品在农产品贸易中的比重偏低，我国农产品贸易的增量主要来源于产业间贸易。我国与美、日、韩、巴四国的双边农产品贸易都存在产业内贸易与产业间贸易并存的现象，但是都是产业间贸易更显著。中韩和中巴农产品产业内贸易水平更是低于中美和中日农产品产业内贸易水平。计量分析的结果表明，每公顷谷类产量差异对中国农产品的无加权产业内贸易水平和水平产业内贸易水平有促进作用，对加权产业内贸易水平和垂直产业内贸易水平起阻碍作用。教育支出占GNI的比重的差异对中国农产品的加权和无加权产业内贸易水平和水平产业内贸易水平起了较大的促进作用，而对垂直产业内贸易水平起着阻碍作用。人均GNI差异对中国农产品的加权和无加权产业内贸易水平和水平产业内贸易水平起了一定的阻碍，而对垂直产业内贸易水平起着促进作用。科研支出占GDP的比重的差异对中国农产品的加权和无加权产业内贸易水平以及垂直产业内贸易水平起了显著的促进作用，而对水平产业内贸易的影响却不显著。外国直接投资（FDI）对中国农产品的加权和无加权产业内贸易水平以及垂直产业内贸易水平有着显著的促进作用，对水平产业内贸易却有着显著的阻碍。贸易伙伴国的GDP水平和人口数对各种产业内贸易指标都有着促进作用。