基于DNA酶和氧化石墨烯的高灵敏荧光生物传感体系的研究

被引量 : 11次 | 上传用户:zhou101302
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
生物传感器(Biosensor)是由生物学、物理学、数学、化学、计算机科学等多个学科交叉融合而发展起来的一门新兴而活跃的学科。近年来新的分子生物学技术不断涌现,并在科学研究和实际应用中得到不断的发展和完善,使生物分子检测的灵敏度和特异性都得到很大的提高。然而随着疾病诊断要求的不断提高与科学研究的不断深入,我们迫切需要发展一些灵敏度高、选择性好、操作简单且成本低廉的生物传感器以便更好地满足科学研究和实际应用的需求。目前提高荧光传感器灵敏度的方法主要有两类:一类是通过使用碳纳米材料等超级猝灭剂提高猝灭效率以降低检测荧光背景,另一类则是利用各种酶切催化循环放大手段提高传感器的灵敏度。基于以上考虑,综合文献报道,本文主要采用可降低背景信号的荧光猝灭剂以及信号放大技术在提高生物传感器的灵敏度方面做了一些工作,主要内容如下:(1)基于DNA酶生物传感体系的研究。DNA酶是利用体外筛选的组合生物学技术获得的一段具有催化功能的DNA片段。在第2章中,我们基于氧化石墨烯(GO)对不同长度的单链DNA具有不同的吸附力设计了一种荧光增强型的DNA酶生物传感器用于铅离子的检测。由于底物链和酶链的杂交探针中含有一段单链DNA序列,故该探针可以吸附在氧化石墨烯上,并使底物链5’端的荧光基团靠近GO,从而导致荧光团的荧光被猝灭。当加入Pb2+后,DNA酶的催化活性被激活,并将底物链切割为两部分。含有荧光团的短链DNA(5个碱基)从酶链上解链游离下来。释放出的酶链可继续与未反应的底物链杂交,同时诱发下一轮的催化切割,如此循环,传感体系中就存在很多标记有荧光团的短链DNA。加入GO之后,由于短链DNA与氧化石墨烯结合力很弱,故荧光团远离氧化石墨烯而使其荧光不被猝灭。该传感器的灵敏度很高,对铅离子的检测限为300pM。上一章报道的DNA酶荧光传感器对酶链有一定的要求,即酶链的环状部分需要有一段长的DNA单链便于杂交探针吸附在GO上。如果环状部分的单链DNA太短或以双链形式存在就会影响杂交探针与GO的结合能力,从而导致传感器的背景荧光增加。因此,利用GO做荧光猝灭剂限制了上述传感器的通用性。在第3章中,我们利用苝二酰亚胺阳离子化合物的团聚体作猝灭剂构建了一个通用的DNA酶生物传感平台。苝二酰亚胺阳离子化合物可以吸附于DNA酶探针上并发生团聚,而其团聚体可以通过荧光共振能量转移猝灭荧光团(FAM)的荧光。铅离子或L-组氨酸的加入使DNA酶的催化活性被激活并将底物链切割为两部分,释放出标记有FAM的短链DNA、另外一段底物链以及DNA酶。被释放的DNA酶可继续同未反应的底物链杂交,同时诱发下一轮的催化切割。由于苝二酰亚胺阳离子化合物主要吸附在酶链和切割后的另外一段底物链上,而标记有FAM的短链DNA只有5个碱基,苝二酰亚胺阳离子化合物很难与其结合,因此FAM的荧光未被猝灭。该传感器具有很高的灵敏度和选择性且通用性好,可用于检测各种目标物。催化信标是当目标物存在时可以催化DNA酶水解底物链从而产生荧光信号增强的荧光检测体系。一般来说,催化信标由标记荧光团的底物链和标记猝灭团的DNA酶链组成,其中底物链与DNA酶链的比例应严格控制在≤1,而这样限制了催化信标在信号放大检测中的应用。另外,这种催化信标荧光猝灭效率较低,因此具有较高的荧光背景。在第4章中,基于具有特殊茎-环结构的分子信标和与之具有相同配对碱基的双链DNA之间熔链温度的差异,我们提出了一种利用分子信标作为底物链,从而避免对DNA酶修饰且能进行多重循环信号放大的新型荧光催化信标。而且该新型催化信标还可作为荧光放大基团用于目标DNA的检测。其动力学响应范围为0.5nM300nM,检测下限为200pM。为了进一步拓宽DNA酶的应用范围,在第5章中,我们基于DNA酶拓扑结构的改变可引起其催化活性的改变构建了一个通用的放大传感平台用于检测DNA序列和酶的活性。由于8-17DNAzyme的部分序列被固定于探针的发夹结构中,故酶的催化活性被抑制。当存在目标物(DNA或甲基化酶)时,目标物和探针作用使其发夹结构被打开,8-17DNA酶从发夹结构中释放出来且催化活性被激活。具有催化活性的8-17DNA酶可与发夹型的分子信标底物杂交形成催化分子信标传感体系。加入锌离子后,DNA酶催化切割分子信标底物,使底物链片段从酶链上游离下来,荧光明显增强。最后游离出来的8-17DNA酶的酶链可重新与分子信标底物杂交,引发下一轮的催化切割,如此循环,实现了目标物的放大检测。此外,我们还利用小分子末端保护策略和DNA酶的信号放大功能实现了蛋白质的放大检测。当不存在链霉亲和素(SA)时,DNA探针被核酸外切酶I(ExoI)切割为单碱基核苷酸,故不能催化切割分子信标底物,因此传感器的背景荧光很低。当存在SA时,探针上标记的生物素和SA结合从而阻止了ExoI切割DNA探针。最后包含8-17DNA酶序列的DNA探针可以催化切割分子信标底物并引起传感体系荧光信号的增强。(2)在第6章中,我们将氧化石墨烯高的荧光猝灭率与核酸外切酶Ⅲ信号放大功能结合构建了一种高灵敏、快速、单标记的DNA荧光传感器。标记有荧光素(FAM)的DNA探针以单链形式存在故不能被核酸外切酶III切割,因此它可以通过π-π堆积作用吸附于GO表面并且荧光被猝灭。当目标DNA和探针链杂交后,核酸外切酶III沿3’→5’方向将探针链切割成碱基碎片,从而目标DNA被释放出来。释放出的目标DNA可继续和其它DNA探针杂交同时诱发第二次酶切循环反应。当酶切反应结束后加入适量的GO,由于DNA探针被切碎,故FAM远离GO而使其荧光不被猝灭。实验结果表明该方法可实现对目标DNA的高灵敏检测,检测下限为20pM。(3)在第7章中,我们利用苝二酰亚胺阳离子化合物作为荧光信号的报告分子,富G核苷酸序列作为铅离子的识别探针构建了一种简单、快速和无标记的荧光增强型铅离子传感器。带正电荷的苝二酰亚胺阳离子化合物和带负电荷的DNA探针之间强的静电吸附作用导致苝二酰亚胺阳离子化合物吸附在DNA探针上并使其荧光被猝灭。当加入铅离子后,DNA探针从单链状态折叠成稳定的G四股螺旋结构。此时,苝二酰亚胺阳离子化合物与G四股螺旋结构的吸附力远低于它与单链DNA的吸附力,使得很多苝二酰亚胺阳离子化合物脱离DNA而游离于溶液中,从而导致传感体系的荧光增强。该传感器的动力学响应范围为10nM-10μM,检测限为4nM。
其他文献
目的:探讨临床护理路径应用于掌骨骨折患者中的效果。方法:以在我院手外科住院的120例掌骨骨折住院患者为研究对象,按患者入院序号随机分组法分为研究组与对照组各60例,对照
目的探讨曼陀罗中毒(datura poisoning,DP)的临床特点。方法回顾性分析24例DP的临床资料、治疗方法及预后情况。结果男性17例,年龄大于60岁22例,来自农村22例,饮曼陀罗籽酒23
我国有2000多个县,7000多个水泥厂,丰富的资源为我国水泥混凝土路面的发展奠定了坚实的物质基础,特别是其使用寿命长,养护费用小的优点,缓解了我国道路建设资金短缺的矛盾,符
目前,大学生中存在着漠视、残害生命的现象,高校生命教育已刻不容缓。音乐教育中蕴涵着生命教育功能,可以利用这些音乐元素对学生进行生命教育,以期在个体生命意识日益凸显的时代
<正> 肉狗之所以被炒作,是因为狗肉是低脂肪、高蛋白食品,且口味鲜美,并具有补身之功效。前些年,由于狗肉供不应求,所以价位较高。近年来,养殖肉狗的多了,狗肉价格有明显下滑
说明了居民健康档案的重要作用,论述了居民健康档案是社区卫生服务工作的基本保证,指出档案人员要提高自身素质才能做好居民健康档案。
目的探讨单钳道内镜跨越式荷包缝合法在封闭医源性胃肠黏膜缺损中的临床价值。方法回顾性分析2015年4月至2016年8月我科消化内镜中心对胃肠道病变行内镜黏膜下剥离术(endosco
针对枸杞传统施肥中存在的问题,结合枸杞的生长特性,研制了一款适宜枸杞的专用播肥机。本文介绍了该机械的结构、工作原理、操作步骤、关键部件参数设计、优势特点和田间性能
心理资源是支撑个体产生或进行各种有意识心理活动以及外在行为的一种能量。目前,有关心理资源方面的研究已经受到国内外心理学者的广泛关注。当心理资源消耗到一定程度时,个
目的:重症医学科为危重患者集中救治的特护病房,老年患者偏多,心力衰竭在老年人群中发病率高,肺部感染可使机体的代谢率增高,提高心肌氧耗而加重心脏的负担,同时肺部感染会使