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家兔的体重和生长速度取决于采食和能量消耗之间的平衡,同时,出栏体重与生长速度对胴体质量和兔肉品质具有显著影响,因此,涉及采食和能量消耗两大生理生化过程的基因有可能与家兔生长性状、屠体性状和肉质性状相关联。减食欲神经肽阿黑皮素原基因(Pro-opiomelanocortin,POMC)和解偶联蛋白2基因(uncoupling protein 2,UCP2)分别涉及采食和能量消耗两大过程。本试验以伊拉兔、香槟兔、天府黑兔、新西兰兔和欧洲大白兔共计797个样本为材料(其中,伊拉兔、香槟兔和天府黑兔测定生长性状、屠体性状和肉质性状,新西兰兔和欧洲大白兔只测定生长性状),以POMC和UCP2为候选基因,采用直接测序法寻找两个基因编码区的遗传变异,研究候选SNPs与家兔部分生产性状的关联性,并对UCP2基因mRNA相对表达量进行了分析,研究结果如下：1.在POMC基因外显子2上检测到一个同义突变c.498 T>G,在内含子1上检测到一个突变位点c.112-12 G>T。多态性分析表明,c.498 T>G在伊拉兔、香槟兔和天府黑兔三个品种中均只检测到GT和GG两种基因型,且表现为低度多态(PIC<0.25)；c.112-12 G>T在伊拉兔、香槟兔和天府黑兔三个品种中检测到GG.GT和TT三种基因型,且均表现为中度多态(0.25<PIC<0.50)。χ2检验表明,两个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。2.POMC基因c.112-12 G>T位点对伊拉兔、香槟兔和天府黑兔的84日龄体重、全净膛重和半净膛重的遗传效应达到显著水平(P<0.05),其中,TT基因型的84日龄体重、全净膛重和半净膛重均显著高于GT基因型(P<0.05)；虽然该位点对熟肉率的遗传效应没有达到显著水平,但多重比较的结果表明,TT基因型的熟肉率显著高于GG基因型(P<0.05)：c.498 T>G位点对家兔生产性状的遗传效应均没有达到显著水平(P>0.05)。3.在UCP2基因中一共检测到14个变异位点,其中6个为位于编码区的同义突变：c.72 G>A(外显子1,Ala,GCG>GCA):c.129 T>C(外显子2, Ile, ATT>ATC)；c.249A>G(外显子2,Val,GTA>GTG)；c.252 T>C(外显子2,Ala, GCT>GCC):c.300 T>C(外显子2,Tyr,TAT>TAC)；c.546 C>A(外显子4,Pro,CCC>CCA).蛋白质结构域预测发现,6个SNPs均位于Solcar结构域,其中,c.72 G>A与c.129 T>C位于第一个跨膜螺旋结构域,c.249 A>G；c.252 T>C和c.300 T>C位于第二个跨膜螺旋结构域中,c.546 C>A位于第四个跨膜螺旋结构域。连锁不平衡分析显示,c.72 G>A与其余5个SNPs位点连锁程度非常强(r2≥0.55),说明该位点与其余5个位点具有相近的遗传效应,最终选择c.72 G>A位点进行后续研究。4.UCP2基因c.72 G>A位点在5个家兔品种中均表现为中度多态(0.25<PIC<0.50)；χ2检验表明,c.72 G>A位点在伊拉兔、香槟兔和天府黑兔中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而在新西兰兔和欧洲大白兔两个品种中严重偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。5.关联分析表明,UCP2基因c.72 G>A位点在伊拉兔、香槟兔和天府黑兔三个品种中对70日龄体重、84日龄体重、全净膛重、半净膛重和肌肉24小时pH的遗传效应达到极显著水平(P<0.01),对平均日增重、半净膛屠宰率的遗传效应达到显著水平(P<0.05)。其中,AA和AG基因型的70日龄体重、84日龄体重、全净膛重和半净膛重极显著高于GG基因型(P<0.01),AA和AG基因型的平均日增重和半净膛屠宰率显著高于GG基因型(P<0.05),GG基因型个体的背最长肌肌肉24小时pH极显著高于AA和AG基因型(P<0.01),GG基因型个体的后腿肌肌肉24小时pH显著高于AA和AG基因型(P<0.05)。同时,c.72 G>A位点与新西兰兔和欧洲大白兔的56日龄体重、70日龄体重以及35-70日龄的平均日增重显著相关。其中,在新西兰兔群体中,AA基因型的56日龄体重、70日龄体重和35-70日龄的平均日增重极显著高于AG和GG基因型(P<0.01)；在欧洲大白兔中,AA基因型个体的56日龄体重显著高于AG基因型(P<0.05),极显著高于GG基因型(P<0.01),AA基因型个体的70日龄体重极显著高于AG和GG基因型(P<0.01),35-70日龄平均日增重AA基因型显著高于GG基因型(P<0.05)。6. mRNA相对表达量分析表明,新西兰兔UCP2基因在肝脏组织中的mRNA表达量随着日龄的增加呈现逐渐下降的趋势,其中,35日龄的表达量(2.2750±0.251)极显著高于56日龄(1.37022±0.272,P=0.01)和70日龄的表达量(0.8109±0.266,P=0.001)；而56日龄的mRNA表达量显著高于70日龄(P=0.029)。c.72 G>A位点不同基因型之间的mRNA表达量差异不显著(P>0.05)。本试验结果发现POMC基因c.112-12 G>T位点和UCP2基因c.72 G>A位点与家兔生长性状、屠体性状和部分肉质性状之间存在关联性,提示这两个SNPs可以作为家兔部分生产性状的分子标记。同时,mRNA表达量分析排除了c.72G>A位点对UCP2基因mRNA表达量的影响。