毛竹（Phyllostachys pubescens）是我国重要的经济和生态竹种。为追求更高的经济效益,人们对原来以粗放经营为主的毛竹林进行了集约化经营。集约经营的主要措施有施肥、去除林下植被、翻耕等。这种集约经营措施虽然提高了毛竹的产量,但也降低了土壤有机质含量和生物多样性,造成了N₂O的大量排放。为揭示毛竹集约经营对土壤硝化和反硝化过程微生物的影响,分别在丽水遂昌和湖州长兴两个地点采集不同集约经营时间（丽水:10、15、20、25年;长兴:6、10、15、20年）毛竹林表层和亚表层（0-20cm和20-40cm）土壤,利用实时荧光定量PCR以及高通量测序方法,对毛竹林长期集约经营过程中土壤硝化微生物AOA（氨氧化古菌）和AOB（氨氧化细菌）以及反硝化功能基因nir K、nir S以及nos Z丰度和群落结构多样性的变化进行分析,主要结果如下:1.与对照相比,集约经营均显著增加了丽水遂昌和湖州长兴毛竹林土壤AOA丰度（P<0.05）。而相较于AOA,集约经营对AOB丰度的提升不大,在长兴集约经营后期甚至出现下降趋势;高通量测序结果显示:集约经营显著改变了AOA和AOB的多样性指数（P<0.05）,但两者表现出完全相反的变化趋势;AOA群落结构同样显著受集约经营影响（P<0.05）,Group I.1a相对丰度在集约经营初期占主导地位,但随着集约经营的进行,其主导地位逐渐被Group I.1a-assoicated取代;而AOB群落中Nitrosospira相对丰度在整个集约经营过程变化不大且始终占主导地位。ABT模型表明土壤NO₃^-含量与毛竹土壤AOA丰度、多样性以及群落结构密切相关。而AOB丰度、多样性以及群落结构则受AK、NH₄⁺含量控制。2.长期集约经营后两地土壤反硝化微生物nir K、nir S以及nos Z丰度均发生显著变化（P<0.05）,丽水遂昌两层土壤的三种功能基因丰度在集约经营10年先上升或保持不变。而在集约经营15年或20年后,三者丰度均有不同程度的下降。但到了集约经营25年,三者丰度又有恢复到对照甚至超越对照的水平。土壤反硝化细菌表现出对集约经营干扰的抵抗和恢复反应。湖州长兴毛竹林除了表层nir K以及nos Z以外,三种反硝化基因分别表现出与丽水类似的变化规律。丽水遂昌毛竹林长期集约经营显著降低了表层和亚表层土壤中nos Z基因多样性（P<0.05）;nos Z群落中Bradyrhizobium相对丰度在集约经营初期占主导地位,随着经营年限的增长逐渐降低。ABT模型表明土壤SOC含量是影响丽水遂昌三种反硝化微生物丰度的关键因子,土壤NO₃^-含量显著控制了湖州长兴三种反硝化微生物丰度;AK是nos Z基因群落多样性以及结构的主要驱动因子。综上所述,本研究表明硝化和反硝化微生物在集约经营过程中变化不同;AOA积极参与硝化作用并在硝化作用中占主导地位,导致土壤硝态氮积累。这一结果不仅增加了土壤硝态氮淋失,而且可能促进反硝化微生物进行反硝化作用,造成土壤氮素损失。因此我们建议在毛竹集约经营过程中减少氮肥施用,使用缓效氮肥或是硝化抑制剂来降低土壤中硝态氮的含量,从而减少不必要的环境破坏或是经济损失。