农杆菌草酸脱羧酶的原核表达与分泌特性验证

来源 :兰州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:daweinihao
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
草酸脱羧酶(oxalate decarboxylases,OXDCs)降解草酸生成甲酸和二氧化碳。该酶属于cupin超家族bicupin亚族,在其氨基酸序列中,含有两个cupin结构域,每个cupin结构域由两个保守的基序:G(X)5HXH(X)11G和G(X)5P(X)4H(X)3N(这里X指代任意氨基酸)组成。目前发现的草酸脱羧酶主要存在于一些腐生真菌和细菌中。一些腐生型真菌在向体外分泌草酸的同时,也能合成草酸脱羧酶分泌到胞外。这种分泌型草酸脱羧酶的存在被认为可以降低草酸对自身的毒性,保持细胞内外稳定的pH环境,保持草酸合成和降解的平衡。细菌来源的草酸脱羧酶主要存在于细胞质中,其功能可能和O.formigenes中的草酰-辅酶A一样,与细菌细胞的能量代谢相关:草酸与甲酸的反向转运造成细胞外高内低的质子浓度差,这种质子梯度又同磷酸化偶联,驱动ATP的合成。但是最近的研究发现,B.subtilis在酸诱导(外加肌醇六磷酸)条件下,草酸脱羧酶(OxdC)是其细胞壁主要成分,在细胞质中没有发现有OxdC的存在;在B.subtilis芽孢发育过程中,草酸脱羧酶(OxdD)能分泌到胞外,是芽孢外壳内层的组成成分。然而在这两个草酸脱羧酶中都没有发现分泌信号的存在,其分泌机制还不清楚。在全基因组测序已经完成的农杆菌C58菌株(Agrobacterium tumefaciens strain C58)的基因组中,发现存在编码产物和已知的草酸脱羧酶在氨基酸序列上表现高度同源的基因序列(定名为AtuOXDC)。我们用PCR方法从A.tumefaciens strain C58基因组中克隆到的AtuOXDC基因,全长1248bp,编码产物为415aa,理论分子量为44.7 kDa。氨基酸序列含两个cupin domain,属cupin超家族bicupin亚族蛋白。其中N-端和C-端cupin domain分别由第120~第175位、第301~第367位氨基酸残基组成,每个cupin domain中两个motif之间相隔(inter-motif region,IMR)20个aa。氨基酸序列分析发现,AtuOXDC N-端含有一段疏水跨膜区(第7~第29位氨基酸),推测可能是一段分泌信号,预测剪切位点在第27和第28位氨基酸残基之间。序列比对和系统树分析表明,AtuOXDC同来自Bradyrhizobium japonicum和Burkholderia的草酸脱羧酶氨基酸序列一致性较高,被聚为一类。同来自真菌的草酸脱羧酶亲缘关系也较近。在大肠杆菌中成功实现了AtuOXDC的过量表达,并通过亲和层析纯化了表达产物,发现AtuOXDC在体外能够降解草酸,确实具有草酸脱羧酶活性。通过在A.tumefaciens strain C58中分别表达全长和截去信号肽序列的AtuOXDC,证明农杆菌草酸脱羧酶N-段确实存在一段分泌信号,并将该酶定位于细胞周质中;通过定点突变试验,用-KK-取代AtuOXDC信号肽序列中Tat信号特征性基序-RR-后,免疫印迹试验表明AtuOXDC向胞外的转运通过Tat途径进行。
其他文献
慢性HBV感染者体内免疫细胞存在功能障碍,免疫功能无法发挥正常作用;其CD4~+、CD8~+T淋巴细胞、NK细胞等免疫细胞表面存在Tim-3、PD-1的过度表达。大量文献表明该现象与HBV持
农村家庭高等教育投资风险根据一般风险的分类标准,可以划分为不同的种类。按照风险波及的范围分类,农村家庭高等教育投资风险可以分为教育质量风险、专业选择风险、就业风险
1 插条的采集从优良品种、单株、生长健壮而又丰产的母株上采集。采集枝龄在1~2a生,枝条粗度为0 5~1cm的营养枝,枝条上的枝刺多,因此用这类枝条育苗发根多,成活率高。采集插条的
采用纤维强伸度仪、拉曼光谱和X射线衍射,对比了不同清洗温度下获得的碳纤维(CF)的单丝拉伸强度、失重率和表面的无序程度,通过扫描电子显微镜、原子力显微镜和X射线光电子能
中医药产业不断发展、走向世界,中医药人才也要与时代的脉搏同步。传统的应用型人才已不能满足中医药迅速发展对人才的需求,构建创新型人才培养模式,是时代赋予各中医药院校
主持人:$$   丁安华$$   招商证券股份有限公司副总裁兼首席经济学家$$   对话嘉宾:$$   陈平 广州市金融办副主任$$   叶俊英 易方达基金董事长$$ 
报纸
各位代表、同志们:$$经过全体代表和与会同志的共同努力,省六届人大三次会议圆满完成了各项议程,即将胜利闭幕。会议期间,各位代表肩负全省人民重托,以饱满的政治热情和良好的精神
报纸
着陆撞击是飞机起落架最重要的载荷情况之一.通过实测数据分析得出某型飞机前、主起落架着陆撞击载荷谱,包括垂直载荷系数谱、起转与回弹载荷系数谱、侧向载荷系数谱及下沉速
目的(1)连续切片苏木精-伊红(hematoxylin and eosin staining,HE)及S100免疫组化染色法(immunohistochemical,IHC)对舌癌同一样本进行判别,比较两者在判断神经(纤维,束)的特