【摘 要】
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本文针对两个物种的不同的蛋白质相互作用研究现状相应采用了两种不同方法。模式生物酵母已经存在大量蛋白质相互作用数据,而且这些数据主要集中于已知蛋白质。我们将未知蛋
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本文针对两个物种的不同的蛋白质相互作用研究现状相应采用了两种不同方法。模式生物酵母已经存在大量蛋白质相互作用数据,而且这些数据主要集中于已知蛋白质。我们将未知蛋白质的用支持向量机预测的相互作用数据结合现有实验数据预测未知蛋白质功能。SVM方法预测的初始数据在通过已知蛋白质的大量实验数据建立的可靠蛋白质相互作用网络中得到筛选。加入SVM数据到测试数据后,功能预测的准确率明显提高。相对地,疟原虫缺少足够的建立蛋白质相互作用网络的实验数据,我们通过genomic-context方法预测其功能相关蛋白质并在功能相关预测数据建立的网络中结合其表达信息分析。这个综合方法显示了一些已知功能蛋白质之间的功能联系,并预测了一些未知蛋白质的功能。这两种综合的网络方法展示了通过预测方法从整体的角度研究基因组的光明未来。
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