2006年～2008年在内蒙古阿拉善荒漠区选择禁牧和过牧两种不同干扰条件下的样地,采用线路铗捕法,运用Spearman和Pearson相关分析,分析啮齿动物群落与植物群落、土壤的相关性。分析结果表明:(1)不同干扰条件下,啮齿动物群落优势鼠种和次优势鼠种的组成各不相同,禁牧区中子午沙鼠和黑线仓鼠为优势种,五趾跳鼠和长爪沙鼠为次优势种;过牧区中三趾跳鼠和小毛足鼠为优势种,子午沙鼠为次优势种。(2)过牧区灌木植物种数略高于禁牧区,禁牧区草本植物种数远高于过牧区。(3)不同干扰条件下表层土壤硬度最小,且禁牧区硬度明显大于过牧区。土壤含水量随土壤深度的增加而升高,过牧干扰使表层土壤含水量降低。(4)不同干扰条件下,各优势鼠种与土壤不同深度层硬度的相关性均未达到显著水平(P<0.05)。在禁牧区,黑线仓鼠与土壤10~15 cm和15~20 cm层的含水量呈显著负相关(P<0.05);五趾跳鼠与土壤0~5cm和5~10cm层的含水量呈极显著负相关(P<0.01),与土壤10~15 cm和15~20 cm层的含水量呈显著负相关(P<0.05)。在过牧区,小毛足鼠与土壤0~5cm、5~10cm和15~20 cm层的含水量呈极显著负相关(P<0.01)。(5)在禁牧区,黑线仓鼠选择刺叶柄棘豆分布的生境;子午沙鼠选择白草或牛尾蒿分布的生境;五趾跳鼠选择珍珠或牛尾蒿分布的生境,不选择白草或小画眉草分布的生境;长爪沙鼠选择红砂或白草分布的生境,不选择短脚锦鸡儿分布的生境。在过牧区中,三趾跳鼠不选择藏锦鸡儿、白草或雾冰藜分布的生境;小毛足鼠选择霸王分布的生境;子午沙鼠选择霸王分布的生境,不选择藏锦鸡儿分布的生境。(6)在不同干扰条件下,阿拉善地区植物群落和啮齿动物群落物种在生态学功能上等价,符合中性理论的假设。