【摘 要】
:
目的基于多数据库构建肾透明细胞癌脂代谢相关基因预后风险预测模型方法我们从基因集数据库(MSig DB)下载并整理得到1437个脂代谢相关基因;从TCGA数据库获取534例cc RCC患者以及72例非肿瘤组织的基因表达数据和临床数据。通过对比癌组织和正常组织,获取差异表达基因((EGs),并与1437个脂代谢相关基因集取交得出cc RCC患者的脂代谢相关DEGs。将其中529例有配对临床信息的cc
论文部分内容阅读
目的基于多数据库构建肾透明细胞癌脂代谢相关基因预后风险预测模型方法我们从基因集数据库(MSig DB)下载并整理得到1437个脂代谢相关基因;从TCGA数据库获取534例cc RCC患者以及72例非肿瘤组织的基因表达数据和临床数据。通过对比癌组织和正常组织,获取差异表达基因((EGs),并与1437个脂代谢相关基因集取交得出cc RCC患者的脂代谢相关DEGs。将其中529例有配对临床信息的cc RCC样本通过随机抽样的方法按照1∶1的比例拆分为训练组(n=265)与验证组(n=264)。在训练组中利用单因素、LASSO回归和多因素Cox回归分析构建cc RCC患者脂代谢相关基因的预后预测模型,并在验证组中对模型进行验证评估。同时我们对脂代谢DEGs进行了GO和KEGG富集分析。结果我们利用TCGA数据库中529个cc RCC和72个正常肾组织的基因表达数据,进行了生物信息学和统计学分析,以研究透明细胞肾细胞癌(cc RCC)中脂代谢基因的预后意义。我们在cc RCC脂代谢相关基因表达数据集中鉴定出了48个上调基因和91个下调基因。通过进一步分析,我们构建了一个基于8个脂代谢DEGs(ITPKA,NOD2,ATP1A1,SCD5,ALDH3B2,THRSP,FABP1和UGT8)的预后风险评分模型,并将cc RCC患者分为高风险组和低风险组。高危cc RCC患者的总生存期(OS)明显短于低危cc RCC患者。预后风险评分模型的受试者工作特征(ROC)曲线分析显示,1年、3年和5年OS的ROC曲线下面积分别为0.819、0.774和0.786。因此,我们的预后模型在TCGA患者队列中显示出了良好的预测能力。我们还建立了一个基于这8个脂代谢DEGs的列线图,并在TCGA队列中进行了内部验证,显示了对cc RCC预后的准确预测。结论我们基于数据库构建的8个脂代谢DEGs预测模型可以有效预测cc RCC患者的预后,并且这8个脂代谢基因可能是肾透明细胞患者的分子生物标志物和治疗靶点。
其他文献
多囊卵巢综合征(PCOS)是常见且疑难的妇科内分泌疾病,以月经不调、不孕、肥胖、黑棘皮征、多毛为主要临床表现,中医无PCOS病名,其症状属于"闭经""崩漏""月经后期""月经过少"等范畴,中医临床常基于五行学说,落实于五脏核心,以"症状-病机"为出发点,心、肝、脾、肺、肾五脏具有相关性,辨证不仅需从整体出发,也需把握脏脏之间关联,对于PCOS这样以症候群为特点的疾病,《傅青主女科》中根据五行相生克
自闭症是一种广泛性发育疾病,已被列入了儿童精神残疾的最大病种。近年来,引起各界人士的广泛关注。自闭症儿童特殊教育学校(简称自闭症学校)是自闭症儿童教育康复的主阵地,其校园景观环境的质量是影响学生学习生活的重要因素,特别是对自闭症儿童这一特殊群体,影响尤为明显。因此,为自闭症儿童营建符合其需求的校园景观具有特殊的意义,然而在这一方面的现有研究略显缺失。本文以6~15岁的自闭症儿童为研究对象,采用实地
随着天然集料的日益缺乏以及国家对固体废弃物再利用的高度重视,煤矸石作为粗集料使用已引起广泛关注。但由于成煤条件和煤炭开采等情况的不同,致使不同地区煤矸石粗集料理化性质和形状特征差异较大。此外,煤矸石粗集料是混凝土内部结构中的薄弱环节,显著影响混凝土性能。为就近合理利用煤矸石,本文选取陕西省不同矿区煤矸石,采用压碎指标、吸水率、坚固性等宏观指标和化学矿物组成、微观形貌、内部孔结构等细观指标评价煤矸石
臭氧混凝耦合体系(Hybrid ozonation-coagulation,HOC)作为污水处理厂的深度处理工艺,对二级出水中溶解性有机物的去除效率较高,但HOC体系中存在臭氧氧化与羟基自由基氧化作用,使得该工艺产生溴酸盐(BrO3-)消毒副产物的风险较高。论文研究了不同条件下HOC工艺中BrO3-的生成特性,明确了HOC工艺的最佳工艺条件,揭示了BrO3-的生成途径贡献率,探索了BrO3-的抑制
辐射空调系统相比传统空调系统具有舒适性高,能耗低、初投资低等优点。但是在新风除湿不到位,室内相对湿度较大,或室内湿负荷剧增时,辐射空调系统末端的辐射板有结露的风险。辐射板结露,在辐射板表面形成潮湿环境,加上灰尘聚集,容易滋生细菌带来卫生问题,同时结露滴落容易对环境产生影响。因此辐射板防结露成为研究重点。办公建筑是辐射供冷系统的主要应用场景,外窗和外门的开启、人员的增加是室内湿负荷增加的主要原因。室
目的本文旨在探讨卵巢恶性肿瘤风险模型(Risk of ovarian malignancy algorithm,ROMA)和哥本哈根指数(Copenhagen index,CPH-I)在早期上皮性卵巢恶性肿瘤(Epithelial ovarian cancer,EOC)中的诊断价值。方法选取2018年1月至2020年12月就诊于我院的139例上皮性卵巢肿瘤患者,包括早期EOC 52例、上皮性卵巢交
目的:探讨基线时光学相干断层扫描和光学相干断层扫描血管成像(OCT和OCTA)特征对糖尿病黄斑水肿(DME)患者抗血管内皮生长因子(VEGF)治疗后最佳矫正视力(BCVA)提高和黄斑中心凹视网膜厚度(CMT)降低的影响因素。方法:回顾性研究。纳入2020年10月—2021年9月于蚌埠医学院第一附属医院眼科治疗的DME患者72例(72眼),其中男41例,女31例;年龄35~77(56.53±7.85
目的:探究血浆中外泌体(exosomes)长链非编码核糖核酸(Long non-coding RNA)MEG3在子宫内膜癌中的表达情况及其与子宫内膜癌病理特征的关系,初步明确血浆外泌体LncRNA MEG3在子宫内膜癌发生、发展中的预测价值,以达到可通过定量观察血浆外泌体LncRNA MEG3的表达来指导临床诊断、治疗。方法:收集2021年1月到2021年7月间来蚌埠医学院第一附属医院住院手术的子
四川盆地战国至西汉初期墓葬出土的铜璜形饰与其他地区表现出大体同步的发展趋势。借鉴了广义中原文化体系中的铜璜形饰,但加上具有地区性特点的纹饰,甚至其形制亦被纳入巴蜀符号体系,使得四川盆地已发现的多数铜璜形饰都可以归入巴蜀系铜器范畴。这充分体现了巴蜀地区在物质文化交流上的超强吸纳与融合能力。因地理环境及对外交流上具有不同特点,成都平原和渝东地区在铜璜形饰的使用种类上也存在一定差异。西汉中晚期以后铜两头
目的:本研究对2型糖尿病性增殖期视网膜病变(proliferative diabetic retinopathy,PDR)玻璃体切除术(pars plana vitrectomy,PPV)后糖尿病性黄斑水肿(diabetic macularedema,DME)的患者分别予玻璃体腔注射抗血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)药物联合577n