人类疾病相关的microRNA预测研究

来源 :厦门大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mixiaoya2008
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MicroRNAs(miRNAs)是一类非编码且有调控功能的小分子RNA。它主要在后转录阶段调控基因的表达,同时,对疾病发病机理的研究有着重要意义。识别与疾病相关的miRNA是研究疾病致病机理的基础。生物实验是一种识别miRNA是否与疾病相关的主要的方法。由于生物方法的一些缺点(如实验成本高、周期长),现已经有许多研究者通过不同的计算方法去发现miRNA与疾病的关联,从而辅助生物实验研究。使用计算方法去预测潜在的疾病与miRNA关联是一种直接且有效地方法。但现在只有少量预测算法可以达到较好的预测准确率,这也是面临的主要问题。因此,本文提出了基于路径的随机游走算法预测潜在的miRNA与疾病关联的方法,从而去克服计算方法的研究挑战。除此之外,本文还从miRNA与疾病的数据网络中提取相似性,并将其作为miRNA与疾病的特征值。基于随机游走的预测算法,游走点通过计算MiRNA与疾病向量的相似性,从疾病向量游走到miRNA向量。从而对于任意给定疾病,可计算miRNA与该疾病的相似性得分,且得分越高的miRNA是越可能与该疾病相关。最后,我们将所提出的算法应用在两种肿瘤数据集中进行miRNA的预测。我们将乳腺肿瘤和胰腺肿瘤作为我们的研究案例,从而检验算法的预测效果。跟已有的模型相比,我们的预测模型取得了更优的预测效果。
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