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目的通过应用公共生物学数据平台研究基质金属蛋白酶家族(Matrix metalloproteinases,MMPs)在膀胱癌中的表达情况及对预后的影响。方法从癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库平台获取膀胱癌患者的MMPs相关数据,通过Kaplan–Meier Plotter平台评估MMPs在膀胱癌患者的预后生存分析情况,制作生存曲线比较MMP各家族成员高、低表达时膀胱癌患者在总生存期(Overall Survival,OS)及无疾病进展生存期(Progress Free Survival,RFS)是否存在差异。将有差异的MMP家族成员进行多因素回归分析,进一步筛选差异基因。将差异表达的MMP家族成员通过Surv Express平台分析MMPs在膀胱癌中的预后价值。在GEPIA平台研究MMPs在正常组织及膀胱癌组织中的m RNA表达情况。通过人类蛋白质图谱分析MMPs在膀胱癌组织及正常膀胱粘膜的蛋白表达情况。通过TIMER平台分析MMPs差异表达基因在膀胱癌中的表达与肿瘤免疫浸润细胞(Tumor-Immune Infiltrating Cells,TIICs)的关系。最后将TCGA获取的患者临床病理信息和筛选后的MMP基因表达量及风险等级合并为多基因预后模型,进行单因素以及多因素Cox回归分析膀胱癌患者的生存预后影响因素,验证MMPs在膀胱癌患者中的预后价值。结果通过Kaplan–Meier Plotter平台分析MMP家族的生存预后,有9组MMP(MMP2、MMP8、MMP9、MMP11、MMP13、MMP14、MMP16、MMP17、MMP24)的高表达与较低的OS相关(P<0.05),7组MMP(MMP10、MMP15、MMP20、MMP21、MMP23A、MMP26、MMP28)的高表达与较高的OS有关(P<0.05),MMP10和MMP24高表达时显示较差的RFS,7组MMP(MMP2、MMP7、MMP9、MMP15、MMP25、MMP26、MMP27)高表达时与较高的RFS有关(P<0.05)。将有差异表达的MMP家族通过多因素分析后筛选出4组MMP:MMP9、MMP16、MMP17、MMP28,提示与膀胱癌的预后密切相关。通过Surv Express平台得到MMP差异基因的风险曲线,MMP家族成员高风险表达时与较差的预后生存相关(P<0.05);在GEPIA平台分析筛选基因在膀胱肿瘤组织和正常组织中m RNA表达情况,MMP9在肿瘤组织中的m RNA表达明显高于正常组织;MMP9、MMP16及MMP17在高级别的膀胱癌中m RNA表达明显高于低级别。通过人类蛋白图谱中,MMP9和MMP16在蛋白表达方面具有明显的差异性表达。MMP9的表达与膀胱癌肿瘤纯度成负相关(cor=-0.052,P=9.44e-31),与CD4+T细胞(cor=0.321,P=3.52e-10)、中性粒细胞(cor=0.371,P=2.89e-13)和树突状细胞(cor=0.483,P=9.35e-23)成正相关;MMP16、MMP17和MMP28的表达均与膀胱癌肿瘤纯度及肿瘤免疫浸润性细胞无明显相关性。通过TCGA数据库下载的膀胱癌患者基本信息及筛选后目标基因表达量,患者风险等级合并成多基因预后模型,进行单因素以及多因素Cox分析,单因素Cox回归模型分析结果显示,年龄、分期、原发肿瘤T、淋巴结转移情况N、MMP9、MMP16、MMP17基因表达量,患者风险评估均与膀胱癌预后生存相关(P<0.05)。进一步将影响膀胱癌预后的因素纳入多因素Cox回归分析,结果显示年龄、淋巴结转移情况N、MMP9、MMP16基因表达量与膀胱癌的预后密切相关,能够作为膀胱癌患者预后的独立影响因素(P<0.05)。结论MMPs在膀胱癌的疾病进展中有多种生物学作用,MMP9和MMP16可作为独立的预后因子用于预测膀胱癌患者的预后情况,为进一步研究膀胱癌的病发机制,膀胱癌早期诊断的生物学指标以及膀胱癌可能的靶点治疗提供相应参考。