黄瓜优异种质资源耐冷相关基因挖掘

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mijun123
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黄瓜作为重要的喜温类蔬菜作物,在我国北方广泛栽培。然而,在冬春季生产中,低温冷害仍是制约黄瓜产量提高的重要因素,筛选耐低温材料,挖掘耐冷基因,培育耐低温品种,是黄瓜研究中的重要问题。在本研究中,利用前期系统比较的黄瓜耐冷性鉴定方法,对黄瓜优异种质进行苗期耐冷性鉴定评价,获得不同耐冷基因源;以不同耐冷级别的黄瓜种质为材料,根据前人已报道的耐冷基因及其他相关信息,从黄瓜基因组中筛选耐冷相关基因,分析其在不同耐冷基因源中的表达特性;以芽期耐冷性差异大的两份材料为亲本,构建RIL群体,并对其进行基因组重测序,构建高密度遗传连锁图谱,对芽期耐冷相关性状进行QTL定位分析。以上研究内容为进一步深入黄瓜耐冷相关基因奠定基础。本文主要研究结果如下:1、在前期田间自然低温对核心种质进行耐冷性评价的基础上,筛选在抗病性等商品性状优良、耐冷性差异明显的优异种质21份,采用经系统比较的6℃苗期恒低温室内人工胁迫鉴定方法,以冷害指数和恢复指数为鉴定指标,对上述种质进行苗期耐冷性鉴定,同时采用隶属函数法进行综合评价。将21份种质的耐冷性分为强耐冷种质1份,耐冷种质2份,中等耐冷、不耐冷及冷敏感种质分别为5份、8份和5份,其中1份强耐冷种质来自我国辽宁省,冷害指数和恢复指数分别为17.0%和72.7%。2、根据拟南芥及其他作物中已报道的耐冷基因并结合相关转录组信息,筛选出12个耐冷相关基因,并利用2份耐冷性差异明显的黄瓜材料,对12个耐冷相关基因进行表达分析,进一步确定5个差异表达基因,利用不同耐冷级别的5份材料研究5个基因在低温胁迫中的表达模式。结果显示,耐冷材料的Csa4M642460表达均上调且相对表达量较高,低温处理后期维持在较高水平,而在冷敏感材料中0-12 h其相对表达量上调,后期相对表达水平不高。Csa1M423150呈现基本相同的变化趋势。推测上述基因可能与黄瓜优异种质耐冷性相关。3、分别以FM1和JD7为耐冷亲本和低温敏感亲本,构建RIL群体。利用二代测序技术,对亲本及群体进行基因组重测序。RIL群体可用多态性SNP标记302710个,并最终得到1495个Bin标记进行连锁分析,构建了一张包含7个连锁群的遗传图谱,覆盖基因组全长855.563 cM,标记间平均遗传距离为0.6 c M。不同连锁群上的标记数目在146~292个之间,长度在91.267~143.201 cM之间。4、本研究共检测到8个于芽期耐冷性相关的位点。以相对发芽率为鉴定指标时,找到4个QTL位点,位于4号和6号染色体上,表型贡献率分别为22.65%、13.91%、6.09%、5.63%;以相对胚根长度为鉴定指标时,找到2个位点,位于4号和7号染色体上,表型贡献率为12.73%、9.60%;以相对鲜重为鉴定指标时,找到2个位点,位于4号和7号染色体上,贡献率为6.99%、7.58%。其中,相对发芽率和相对胚根长度在4号染色体上有一个位点存在部分重合,相对胚根长度和相对鲜重在7号染色体上的位点存在部分重合。
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