经哈维氏弧菌感染后帆纳滨对虾的鳃、肝胰腺和心脏的转录组分析

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对虾养殖业是全球重要的粮食生产产业。现时,对虾养殖正受到许多挑战,包括疾病的爆发、抗生素的过度使用和养殖环境的恶化。这些挑战,包括在分子水平上对对虾免疫系统,现时尚未完全了解。帆纳滨对虾(L.vannamei)是全球重要的养殖品种。尽管如此,哈维氏弧菌的感染给对对虾养殖业造成了巨大的经济损失。现时,我们对对虾受哈维氏弧菌感染后的免疫反应了解甚少。因此,研究帆纳滨对虾对哈维氏弧菌感染的免疫反应,将对改善对虾健康养殖至关重要。下面总结了该研究的主要结果:1哈维氏弧菌感染后帆纳滨对虾的转录学概况研究报告揭示帆纳滨对虾在注射细菌后的腮、肝胰腺及心脏的基因转录改变的数据。RNAseq数据中总共获得了33,353个高质量的单个基因。比较基因组分析显示,在哈维氏菌感染后,有9,752个差异表达的基因(DEGs),包括5,067个向上调节的基因和4,687个向下调控基因。选取了7个可能参与免疫的DEG,通过实时定量RT-PCR进行进一步分析,结果表明其表达模式与获得的转录组数据一致。2基因表达模式和基因表达的组织分布对虾的免疫系统,主要是通过先天免疫和细胞免疫反应识别和破坏入侵病源。目前的研究重点是先天免疫。结果发现四个可能是参与虾免疫反应有关重要基因,包括;C-域蛋白(SVWC)、C型凝集素(CTL)、几丁质蛋白(CBP)和抗茵肽,3个为向上调节基因。基因组织表达分析结果为:单一Von Willebrand因子C域蛋白都在腮、心、胃、肠、脑和肌肉表达,但在腮中表达量最高。C型凝集素基因在血细胞、腮、胃、肠、神经、脑和肌肉中表达,但在细胞和胃中表达最高。几丁质合蛋白在细胞、眼柄、鳃、肝胰腺、心脏、胃、肠、神经、大脑和肌肉中表达,但在鳃中表达最高。抗菌肽(Peneidin)在血细胞、腮、心、胃、肠和神经中表达,但在血细胞中表达量最高。3 RNAi干扰和细菌清除实验测定为进一步扩大研究,我们进行了RNAi实验。先制备这些基因的双链RNA,并注射到健康虾中,以期沉默其中三个向上调节基因的表达,并研究这些特定基因的功能。研究发现,当C-域蛋白(SVWC)及C型凝集素(CTL)基因表达被沉默时,L.vannamei抵抗哈维氏弧菌感染的能力显著下降,但当CBP基因表达被沉默时后,L.vannamei抗感染的能力得到提高。所得结果表明,这三种基因在抗菌免疫中起着至关重要的作用,在对抗入侵的哈维氏弧菌起着免疫作用。4结论本研究先构建受哈维氏弧菌感染后不同组织的转录组,并筛选了几个被认为是参与帆纳滨对虾对哈维氏弧菌有免疫反应的基因,进行研究。本研究结果将填補我们对帆纳滨对虾先天免疫系统不足的知识,对将来创造一种对抗哈维氏弧菌感染的养殖技术提供指导。
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