【摘 要】
:
寡腺苷酸合成酶样蛋白(Oligoadenylate synthase-like protein synthetase,OASL)基因是干扰素刺激基因之一,其蛋白家族包含OAS1、OAS2、OAS3和OASL共四种蛋白。目前,在禽类体内只发现了 OASL一种蛋白。本文以OASL基因为研究对象,克隆了高邮鸭OASL基因全序列并进行了生物信息学分析,接着对北京鸭、高邮鸭、蒲田黑鸭和绍鸭4个不同种群鸭OA
论文部分内容阅读
寡腺苷酸合成酶样蛋白(Oligoadenylate synthase-like protein synthetase,OASL)基因是干扰素刺激基因之一,其蛋白家族包含OAS1、OAS2、OAS3和OASL共四种蛋白。目前,在禽类体内只发现了 OASL一种蛋白。本文以OASL基因为研究对象,克隆了高邮鸭OASL基因全序列并进行了生物信息学分析,接着对北京鸭、高邮鸭、蒲田黑鸭和绍鸭4个不同种群鸭OASL基因的部分序列进行PCR扩增,分析不同种群鸭之间OASL基因的多态性,并通过人工构建雏鸭肝炎模型来比较OASL基因在健康雏鸭和感染雏鸭体内各组织的分布以及表达量的变化。以期为OASL分子进化及抗病毒免疫机制的研究提供相关基础。1高邮鸭OASL基因的克隆及生物信息学分析本实验以高邮鸭为研究对象,以樱桃谷鸭、凤头潜鸭、鸡、鹅的OASL基因保守序列为模板,设计5对针对不同区域的引物,经PCR扩增和序列拼接共得到共4321bp的碱基序列,编码443个氨基酸。经生物学软件预测得出:其二级结构由α螺旋、延伸链和无规则卷曲组成,典型的结构域为N端的寡腺苷酸合成酶样结构域和C端两个串联的泛素样结构域。该蛋白属于亲水性蛋白,无信号肽位点和跨膜结构,糖基化位点预测发现3个潜在的N-糖基化位点和13个O-糖基化位点。进化树结果显示,禽类中鸭和原鸡聚为同一分支,同源性高达100%,哺乳类处除小鼠外,其他物种均同属于一个分支,亲缘关系较近。通过生物信息学方面的预测分析和进化树的构建,为深入了解OASL分子的遗传变异和发挥抗病毒功能的分子机制提供基础,从而将研究成果运用到家禽的抗病育种实践。2 OASL基因多态性比较本实验以北京鸭、高邮鸭、蒲田黑鸭和绍鸭为实验对象,扩增OASL基因5’调控区部分序列并进行多态性分析,共发现5个单核苷酸多态性(SNP)位点(g.73C>T、g.95G>A、g.196T>C、g.280C>G、g.619C>G)。通过 Popgene32 软件计算各等位基因的多态信息值,结果显示:5个多态性位点中,除北京鸭之外,g.73和g.95处杂合度较高,绍鸭和高邮鸭群在g.196处和g.619处杂合度为0。多态信息含量结果显示:蒲田黑鸭五个位点均为中度多态(0.25
肺脏(9.41±0.34)>肝脏(8.53±0.34)>胰腺(5.7±0.62)>小肠(5.4±0.27),即小肠的基因表达量最高,其次为胰腺、肝脏和肺脏,心脏相对表达量最低。而在攻毒组雏鸭体内,各组织的ACt分别为胰腺(3.67±0.11)>肺脏(3.63±0.41)>心脏(3.36±0.43)>小肠(3.31±0.63)>肝脏(3.24±0.33),即肝脏的基因表达量最高,其次为小肠、心脏和肺脏,胰腺相对表达量最低。经2-ΔΔCt法计算得出:攻毒后OASL基因在各个组织内的表达量均显著升高,肝脏、心脏、肺脏、小肠和胰腺的基因表达量分别是对照组雏鸭基因表达量的39.21、92.86、54.58、4.18、4.02倍,在所检测的5个组织中,心脏的上调倍数最高。提示心脏可能是抗病毒基因表达的重要组织。结论:(1)高邮鸭OASL基因由4321bp的碱基序列组成,编码443个氨基酸,经预测无信号肽和跨膜结构,有3个潜在的N-糖基化位点和13个O-糖基化位点,为亲水性蛋白。(2)比较OASL基因多态性,总体而言,g.73与g.95、g.73与g.280、g.95与g.196、g.95与g.280、g.95与g.619位点之间呈强连锁不平衡状态,g.196与g.619之间呈完全连锁不平衡状态,蒲田黑鸭相对北京鸭、高邮鸭和绍鸭具有较高的杂合度。(3)OASL基因在感染DHAV-3鸭的肝脏、心脏、肺脏、小肠、胰腺内表达量均有显著上调,其中心脏上调倍数最多。
其他文献
随着无线通信网络的飞速发展,用户对于高清视频业务的需求日益增加。然而视频质量的不断提升,导致对于无线网络中的传输速率和效率的要求日益提高,同时带宽资源也显得捉襟见肘。为了解决上述问题,在靠近用户侧进行文件缓存成为了可行并有效的方法。因此如何进行文件缓存直接影响到了通信成本和用户体验。我们尝试在无线通信网络中解决这一问题。论文主要研究如何优化缓存放置和路由选择策略,以此来降低运营商成本和通信延迟以提
《御撰资治通鉴纲目三编》是清官方于乾隆年间修纂的一部记载明朝史事的断代纲目体史籍。该书在修纂时经历了初修和重修两个阶段,形成了初修本和重修本两个版本。初修本遭官方查缴,重修本实为官方钦定的版本。该书在史料来源上以《明史》为主,以《明实录》为补充并杂取其他私人史著。在史料运用上具有善于剪裁,注重考证的特点。该书在思想上则具有传统纲目体史著义理史学的影子,一方面注重通过谨严的书法对历史人物、历史事件进
苏东41-33区块位于鄂尔多斯盆地伊陕斜坡东北部,长期沉积间断的风化壳不整合面形成复杂的岩溶古地貌,属苏里格气田奥陶系碳酸盐岩气藏的重要勘探区。本文以马五段风化壳储层为研究对象,基于最新的钻井、测井、地震及生产动态资料,综合采用地球物理法、残厚法和印模法对古地貌进行精细刻画,通过岩心观察、薄片鉴定、压汞实验等分析手段完成储层地质特征、气藏开发特征和含气系统的研究,系统总结了气藏分布特征及主控因素,
装配式混凝土结构具有施工速度快、节能环保、劳动力需求少等优点,是我国建筑业发展的方向。目前装配式预制板的应用主要是基于不同连接方式的叠合板,湿作业量较大且施工质量不宜保证。为此课题组提出一种暗梁式全预制板连接方法,暗梁式全预制板连接是基于全预制板的一种新型连接方式。该连接方式在连接处传力连续、整体性好,减少了大量的湿作业,在保证承载力的同时还具有施工便捷、节能环保等优势,具有较高的应用前景。基于A
最近,由于基于地理位置的社会网(LBSNs)的不断应用,许多基于此开发的app(比如美团、百度地图、大众点评等)的不断兴起,POI(Point-of-Interest)推荐的问题越来越引起人们的兴趣。用户需要POI推荐来解决他们“下一步去哪”的问题,同时,POI推荐也广泛的被应用到2B、2C等领域。本文主要解决的问题是基于时空信息和社会网的POI推荐问题,包括如下三个子问题:首先,本文根据POI推
中立帮助行为是外观上表现为无害、中立,但实际上却为正犯行为提供了便利,且主观上对他人犯罪有所认识的行为,理论上对其可罚性颇多争议。混合惹起说主张共犯处罚依据在于共犯的不法独立性和不法连带性,在否认“无正犯的共犯”的同时肯定“无共犯的正犯”,为中立帮助行为出罪提供了理论依据。由于客观归责论与混合惹起说相契合,能够对帮助行为进行价值判断从而解释帮助犯自身的不法,从因果关系的角度解释帮助犯因促进犯罪结果
留守儿童在我国现阶段是一个极为重要的群体,在经济高速发展的今天,他们可能因为家庭和区域的原因没有享受到该有的经济发展下的红利,所以,教育界一直致力于研究如何去关爱农
基于位置的社交网络(Location-Based Social Network,LBSN)规模日渐扩大,人们乐于在LBSN上进行签到,同时分享自己的位置信息和社交关系。LBSN上的签到行为生成大量的位置社交数据,其对用户提供个性化服务具有重要价值。为了让用户更易获得符合其偏好的位置信息,兴趣点(Point of Interest,POI)推荐应运而生。兴趣点推荐面临着数据稀疏、个性化不足等问题,在
信用卡业务作为一种非现金业务,属于银行的核心内容以及主要的收入来源,因此其市场竞争相当激烈。而这种激烈的竞争所带来的业务量极具增加的同时,也使银行承担着巨大的风险,除了违约造成的巨大金额损失外,还有一定的催收成本。因此,对用户的违约行为进行预警,提前识别信用卡违约用户就显得尤为重要。本文数据为某大型银行2015―2017年之间的信用卡违约记录数据集。此数据集共有15万条数据,包含11个特征变量,其
肌钙蛋白Ⅰ激酶(TNNⅠ3K)是心脏病的新兴靶点。研究表明,TNNⅠ3K的表达水平降低具有心脏保护作用。本文通过计算机辅助药物设计技术获得潜在的TNNⅠ3K抑制剂分子,希望所得结果能为高活性TNNⅠ3K抑制剂的开发奠定理论基础。本试验通过构建Co MFA、Co MSIA和Topomer Co MFA模型,研究了一系列TNNⅠ3K抑制剂的结构与活性关系。所得Co MFA、Co MSIA和Topome