突发公共卫生事件发生时,新型主流媒体的议程设置对于引导网络舆论、缓解负面情绪至关重要。本研究使用网络爬虫软件Gooseeker,以社交媒体时代最为严重的突发公共卫生事件——新型冠状病毒肺炎疫情为例,引入第三层次议程设置理论对《人民日报》微博议程设置的特点、效果进行分析,并从中发现问题,提出建议。研究发现,《人民日报》微博通过多种形式积极主动地设置议程,其议程具有建设性倾向,努力挖掘事件的积极意义,科普议题在议程网络中占有重要地位,而敏感性议题处于网络边缘。在议程设置效果上,媒介与受众的议程网络间不具有显著相关性,受众议程更关注敏感议题,呈现出消极趋向。且议程设置存在议题欠缺考证、敏感议题设置滞后、议程要素间关联性较弱等不足,还面临议题难以进入公众视野、价值观难以被普遍认同、议题传播容易失焦等瓶颈。基于此本文提出以下应对建议,加强内容把关、主动设置敏感议题、构建各要素间的联系、注重媒介深度融合、借力大数据技术、强化情绪设置,以期提高新型主流媒体在突发公共卫生事件中议程设置能力。