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随着蛋白质组学技术和方法研究的深入,蛋白组学研究已由原来的两谱三图三库进一步向蛋白质组深度覆盖和定量研究发展。蛋白质组深度覆盖是蛋白质组注释基因组、发现诊断标志物、药物靶标和关键蛋白质分子的前提和基础,而蛋白质组定量信息的获得有利于蛋白质功能的发现和深度解析。蛋白质组深度覆盖的含义包括蛋白质组中蛋白质鉴定的深度覆盖和蛋白质序列的长度覆盖。随着液相色谱及质谱技术的迅速发展,液相色谱-质谱联用技术已经成为实现蛋白质组深度覆盖和蛋白质组定量的常用手段。然而由于在蛋白质组分析过程中,存在蛋白质样品制备时产生