LncRNA H19和IGF2在乳腺癌中的表达与印记丢失的研究

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研究目的:研究LncRNA H19和IGF2在乳腺癌组织中的表达水平与乳腺癌病理的相关性,探讨lncRNA H19和IGF2印记丢失在乳腺癌中的作用。研究方法:1.应用实时荧光定量PCR检测lncRNA H19(120例)和IGF2(134例)在乳腺癌组织及癌旁组织中的表达水平,采用SPSS22.0行统计学配对t检验分析lncRNA H19和IGF2在乳腺癌组织及癌旁组织中的表达差异。2.通过PCR方法扩增全基因组DNA中IGF2(Apa I位点)和H19(Alu I位点)片段,胶回收纯化测序。利用单核苷酸多态性来区分等位基因表达情况即纯合或杂合。基因组DNA中IGF2(Apa I位点)或H19(Alu I位点)为杂合可则进行印记分析,通过PCR方法扩增m RNA IGF2(Apa I位点)和H19(Alu I位点)片段,确定lncRNA H19和IGF2在乳腺癌中的印记状态,采用SPSS22.0行非参数检验分析IGF2印记丢失组(22例)与印记保持组(38例)表达的差异。3.采用SPSS22.0行秩和χ2检验分析lncRNA H19和IGF2在乳腺癌组织中印记丢失组、印记保持组与临床分型及病理信息的关系,包括ER、PR、HER2、肿瘤大小、淋巴结转移等。通过统计学Pearson方法分析乳腺癌组织中lncRNA H19与IGF2的相关性。研究结果:1.实时荧光定量PCR检测乳腺癌组织中LncRNA H19的表达水平为(0.088±0.014),明显高于癌旁组织中LncRNA H19的表达水平(0.024±0.005);乳腺癌组织中IGF2的表达水平为(0.348±0.036),明显高于癌旁组织中IGF2的表达水平(0.095±0.0183)。乳腺癌组织lncRNAH19与IGF2的表达水平均高于癌旁组织且具有正相关性,r为0.567(P=0.00011)。2.lncRNA H19和IGF2在乳腺癌中都存在印记丢失。通过基因测序确定IGF2印记丢失发生频率为36.7%(22例LOI、38例MOI,22/60),明显高于LncRNA H19印记丢失频率4.3%(2例印记丢失、45例印记保持,2/47)。3.乳腺癌组织通过实时荧光定量PCR检测IGF2印记丢失组表达水平为(0.127±0.226),印记维持组表达水平(0.053±0.156)。乳腺癌组织中IGF2印记丢失组m RNA表达水平明显高于印记维持组。LncRNA H19印记丢失病例少(2例)未能进行统计学分析。结论:1.LncRNA H19和IGF2在乳腺癌组织中的表达水平均高于癌旁组织,基因表达水平呈正相关,为乳腺癌的诊断提供新的分子标志。2.乳腺癌中存在LncRNA H19和IGF2印记丢失,其中IGF2印记丢失的发生率明显高于LncRNA H19。3.乳腺癌组织中IGF2印记丢失组其表达水平明显高于印记维持组,提示IGF2印记丢失可能是乳腺癌发生的重要因素之一。
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