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本研究以我国20份水芹(Oenanthe stolonifera D.C)种质资源为材料,对20份材料进行RAPD分析,并在上述研究的基础上,研究了38个形态学性状。从分子水平和形态学学分析了它们之间的亲缘关系,进而为水芹育种和遗传改良奠定了基础。主要结论如下:1经条件优化获得可用于水芹RAPD分子标记分析水芹种质资源多样性的优化体系。20ul扩增反应体系中含模板DNA 20 ng、Mg2+2ul、引物0.4ul、dNTP 0.8ul、Taq酶0.2ul、10*PCR缓冲液2uL、ddH2O补足。扩增程序为:95℃预变性5min;然后按94℃变性45 s,37℃复性45 s, 72℃延伸90 s,循环45次;最后在72℃延伸6min。2本实验从70个随机引物中筛选出个11个多态性稳定的引物对20份水芹资源进行RAPD分析。11个随机引物扩增出117条条带,其中多态性条带114条,占总扩增片段的97%,表明参试的水芹品种资源具有较丰富的遗传多样性。3按照RAPD聚类分析,结果表明:聚类结果在一定程度上反映了材料的地理分布情况,说明地理因素对品种有很大的影响。但是,也有来自不同地区的材料遗传距离相近,这可能是材料具有相似的环境条件或相近的人工选择。4对20份水芹种质资源的38个生物学性状进行统计聚类,结果表明,与RAPD聚类结果有一定程度的相似性。在分析的同时分别建立形态学和RAPD标记的数据库,今后引进新种质可以通过辨别分析确定与其他种质的亲缘关系。RAPD标记检测的多态性是品种DNA水平的差异,而品种的表现型值是品种的基因型值、环境效应和基因型与环境互作效应的综合结果。两种方法都能从各自的角度提供有价值的信息,因此从多个水平,借助多种研究手段,综合评价种质资源的遗传多样,可以更好地保护和利用种质资源。