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植物病毒病是作物上的一类重要病害,种类多,传播途径广,且缺少有效的防治药剂和措施。因此,植物病毒病一旦流行,就会给农业生产造成惨重损失。明确病毒种类及传播途径是防治病毒病的关键。鉴于此,本研究主要围绕辣椒中辣椒轻斑驳病毒(Pepper mild mottle virus, PMMoV)的检测和枣树病毒的鉴定展开,进一步明确了PMMoV的发生分布及传播途径,并初步鉴定出枣树中几种新病毒,为相关病毒病的防控奠定了理论基础。PMMoV侵染辣椒后,使辣椒呈现叶片皱缩、果实变小等症状,对辣椒生产危害极大,而且是第一个已知的可能危及人类健康的植物病毒。本研究利用RT-PCR技术对我国部分地区鲜食辣椒和辣椒加工品中的PMMoV进行了检测。其中,鲜食辣椒样品中PMMoV检出率为75.5%,在各主要产区发生率均比较高且没有明显的地区差异性；147份辣椒加工品中有97份检测到PMMoV,且所采集的每一类别的辣椒制品中都有阳性样品。这表明PMMoV不仅广泛分布于我国辣椒种植区,而且在多种辣椒加工品中的侵染率较高。PMMoV在辣椒深加工品(如酱菜、泡菜)中的存在验证了PMMoV粒子的稳定性。该研究进一步明确了PMMoV的发生分布及可能的传播途径,为该病毒的防控提供了理论依据。枣树是具有民族特色的优势树种,是我国果树发展中的一个新热点。到目前为止,在枣树上没有任何关于病毒的报道。本研究对枣树中可能存在的病毒进行了鉴定,对采自新疆的有200年树龄的枣树样品进行了高通量测序,发现该枣树样品中含有多种杆状DNA病毒(Badnavirus),并获得其中一种的基因组序列,暂时将其命名为枣树杆状DNA病毒1 (Jujube badnavirus 1, JBV-1)。JBV-1基因组为双链环状DNA,全长为6461 bp。基因组正链包含7个开放阅读框(Open reading frames, ORFs),包括3个杆状DNA病毒保守的ORFs,前两个ORFs编码2个不同的小的蛋白,第3个ORF编码一个大的多聚蛋白。基于病毒全长核酸序列构建的系统发育树结果显示,JBV-1与其他杆状DNA病毒处于同一分组中,与天竺葵镶脉病毒(Pelargonium vein banding virus, PVBV)的亲缘关系最近。本研究首次对枣树上的病毒进行了鉴定,为研究枣树病毒的生物学特性奠定了基础,为进一步明确我国枣树病毒种类及防治病毒危害奠定了重要基础。