水体景观是九寨沟的核心,水质的状况影响着水生态系统的演替和景观的美学价值。浮游植物作为水体环境中的初级生产者,能对水体状况进行迅速响应,对水环境监测和保护起着重要的作用。本研究于2014年7月25日至8月6日选取九寨沟自保护区内的主要12个湖泊,对各湖泊浮游植物群落结构与水质状况进行调查,并分析长海和五花海浮游植物空间分布的变化,主要结论如下:九寨沟自然保护区主要的湖泊,共鉴定浮游植物138种,隶属7门69属,其中硅藻门种类最多为42属108种,绿藻门15属17种,蓝藻门5属6种,其它门共7属7种,其中偶然性浮游植物-着生硅藻占主要类群,真性浮游植物多为中心纲的硅藻和其他门类的藻类。各湖泊间浮游植物群落结构存在差异。除了则查洼沟内的长海,其浮游植物优势种主要为真性浮游植物长海小环藻(Cyclotella changhai)和角甲藻(Ceratium hirundinella),日则沟和树正沟内的多数湖泊均以偶然性浮游植物-着生硅藻为主。树正沟的各湖泊浮游植物优势种组成相似,均以硅藻门的Achnanthidium minutissimum,Cyclotella changhai,Delicata delicatula,Denticula tenuis为主要优势种。日则沟内的湖泊浮游植物优势种组成各不相同,部分湖泊出现非硅藻门的优势种,其中箭竹海主要优势种为甲藻门的裸甲藻(Gymnodinium sp.),熊猫海的优势种有甲藻门的多甲藻(Peridinium sp.)和金藻门的分歧锥囊藻(Dinobryon divergens),五花海的优势种出现绿藻门的衣藻(Chlamydomonas sp.)。长海和五花海浮游植物空间分布的研究显示:长海浮游植物在水平和垂直分布上,受到人为干扰较小,主要受到湖泊本身构造和水体理化条件的影响呈现规律性变化,浮游植物丰度(ind./L)受到长海小环藻的影响,在水平分布上沿入水口至出水口方向逐渐增多,沿岸区高于湖心区,垂直分布上呈现先增加后减小的趋势;浮游植物生物量(mg/L)受到长海小环藻和角甲藻的共同影响,在水平分布上呈现湖泊中部生物量高于出水口和入水口区域的格局,垂直分布上水面表层生物量最高,随着深度下降,呈现先增加后减小。五花海浮游植物丰度的水平空间分布上的趋势,显示观景平台附近的浮游植物丰度最大,主要是衣藻和偶然性浮游硅藻为主,呈现边缘区域向湖心区扩散减小的趋势。综合各种水质评价方法,可以得到九寨沟自然保护区主要湖泊的多数水体清洁,贫营养化。五花海沿岸区域轻度污染。通过浮游植物群落结构的组成来判断湖泊生态类型,熊猫海和箭竹海湖泊藻型化趋势明显。