上个世纪90年代，人类基因组计划的实施标志着生物学的发展进入了基因组时代。这个时代最显著的特征是各种分子数据呈现爆炸性增长。随着WWW的蓬勃发展，通过因特网来传播生物信息是最快捷和最方便的手段。然而，由于生物数据的复杂性、庞大性以及生物数据格式的复杂性、多样性，使得生物数据的获取和整合变得十分困难。与传统数据库中高度结构化的数据相比，Web上的数据最大特点就是结构化特征较弱，通常是半结构化的，甚至是无结构化的，而且每个数据源都是分散的、自治的，生物学家们要想获取相关数据异常得艰难。因此，如何有效地发布、传输及整合来自不同数据源的数据是当前生物信息学和基因组、蛋白组科学中的重要课题之一。以XML技术为核心的Web Services是下一代Internet，已经被业界广泛应用于电子商务。作为一种完全结构化的数据格式，XML被生物信息团体用来描述生物学数据。本论文以Web Services跨平台的特点，在分布式的环境中发布和整合以XML格式的生物数据。 利用抑制削减杂交和基因芯片技术获得一批黄孢原毛平革菌(Phanerochaete chrysosporium)特异表达的EST序列，使用Phrap、EMBOSS、Blast、GENSCAN、MZEF软件，基于Linux操作系统，构建了EST序列分析系统，完成了从EST和基因组Blast数据库的构建，载体序列的去除，EST序列的分类和组装，EST序列在基因组上的定位，外显子和内含子的识别以及基因预测。并通过使用perl语言结合bioperl模块编写的脚本程序使分析过程。呵大李城士李位论次自动化，从而可以快速地对大批EST序列进行分析，为克隆相关基因及研究黄抱原毛平革菌功能基因组学提供有用的信息。关键词Language生物数据整合生物数据发布Web serviees eXtensible MarkuP(X ML)生物信息学黄抱原毛平革菌EST