以iTRAQ技术研究大鼠肝纤维化发展为肝癌过程中的关键蛋白

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目的:分析肝纤维化-肝癌动物模型中四个时间点肝组织差异表达的蛋白,寻找肝纤维化发展为肝癌过程中的关键蛋白。方法:利用二乙基亚硝胺建立大鼠肝纤维化-肝癌模型,提取模型大鼠中第4周,第10周,第12周,第18周四个时间点的肝组织蛋白,以正常喂养的大鼠肝组织作为对照组,采用iTRAQ结合2D-LC-MS/MS定量蛋白质组学技术分析肝组织中差异表达的蛋白质。从生物过程、细胞成分注释、分子功能、信号通路富集、蛋白之间相互作用五大方面对筛选出的差异蛋白进行深层次分析。结果:质谱分析共鉴定到2085个蛋白,各个时间点筛选到的差异表达蛋白为:第4周148个,上调蛋白61个,下调蛋白87个;第10周233个,上调蛋白87个,下调蛋白146个;第12周72个,上调蛋白38个,下调蛋白34个;第18周573个,上调蛋白210个,下调蛋白363个。在四个时间点均重复鉴定到的蛋白有23个,含上调蛋白有10个,下调蛋白有13个。GO分析表明,差异表达的蛋白在细胞生物过程功能中主要参与代谢过程、细胞过程、生物学调节和细胞信号传导等过程;在细胞位置中主要附着于细胞器、细胞膜上、细胞外基质、突触、细胞结合等位置;在分子功能中主要参与催化活性、绑定功能、转运、酶活性调节、抗氧化等功能。信号通路富集分析发现,差异表达的蛋白主要参与氨基酸降解、化学致癌、二羧酸代谢、色氨酸代谢、甾类激素的生物合成、糖酵解等相关通路。蛋白相互作用分析显示,处在蛋白互作关键节点的蛋白有细胞色素P450系3A1、细胞色素P450系2C55、谷胱甘肽转移酶a5、谷胱甘肽转移酶α2、谷胱甘肽转移酶P、增殖细胞核抗原、丝裂原活化蛋白激酶3、α2-HS-糖蛋白、细胞周期依赖性激酶4、α1巨球蛋白、醛糖还原酶和纤维蛋白原等蛋白。结论:(1)成功构建二乙基亚硝胺诱导的大鼠肝纤维化-肝癌模型,并在造模的四个时间点,从组织病理学上揭示了肝纤维化发展成为肝癌过程(2)细胞周期依赖性激酶4、α1巨球蛋白、a2-HS-糖蛋白、丝裂原活化蛋白激酶3、羧酸酯酶2c等参与多种生物信号途径,并处在蛋白质相互作用网络的节点上,与肝纤维化或肝癌密切相关,可能为肝纤维化发展为肝癌的关键蛋白。(3) PI3K-Akt信号通路与细胞色素P450信号通路中的丝裂原活化蛋白激酶3、细胞周期蛋白依赖性激酶4,层粘连蛋白家族、谷胱甘肽-S-转移酶家族蛋白、细胞色素P4501A2家族蛋白等30个蛋白在肝纤维化-肝癌大鼠模型中的表达量发生了显著变化,提示这两条生物信号通路可能是肝纤维化发展为肝癌的两个重要的调控通路。
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