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本文从蛋白芯片的分类及其发展方向的分析着手，以全球蛋白芯片行业的环境、现状及前景分析为背景，运用波特的五种竞争力量分析方法来分析所处的竞争环境，结合中国蛋白芯片行业所处的现状来分析遭遇困境的原因。
并以上海数康生物科技有限公司为例深入分析中国蛋白芯片产业发展进程中出现的问题，并用SWOT分析方法来分析其所面临的机遇和威胁，具有的优势与劣势，分析出上海数康可能的战略——合作战略与技术战略，再与上海数康实际采取的战略行为——纵向一体化、合作联盟、产品的多元化作对照分析。
最后对生物芯片行业以后的发展提出建议性对策，希望能够为中国蛋白芯片行业的发展作些补充性的探索。