内源香蕉条斑病毒(eBSV)的基因型分析及激活

来源 :广东海洋大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hutao95
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
香蕉是一种重要的水果。大多数香蕉来源于尖叶蕉(M.acuminate,AA)和长梗蕉(M.balbisiana,BB)。栽培的香蕉可分为香芽蕉(AAA)、大蕉(ABB)和粉蕉(ABB)3种主要类型。近年来,香蕉条斑病毒病给香蕉的生产和种质交换造成了严重的威胁,其病原物为香蕉条斑病毒(Banana streak virus,BSV)。在我国已从广东香芽蕉中分离出一种BSV,按病毒的分类为BSOLV的一个变种,称为BSOLV-GD(Banana streak OL virus Guangdong)。香蕉基因组中发现了与附加体BSV病毒高度同源的序列,将此序列称为香蕉的内源BSV(endogenous BSV,eBSV),而将独立于染色体外的BSV称为附加体病毒(episomal BSV)。已描述的eBSV具有相似的结构,它们将病毒基因组片段化、重复和倒置。eBSV具有不同的基因型,可分为感染型和非感染型,感染型的可以激活产生附加体病毒从而引起香蕉发生条斑病。为明确香蕉中不同基因型eBSV的激活及其机制,根据长梗蕉中一个与BSOLV-GD相应的e BSV(eBSOLV-GD)的结构设计引物,分析香蕉中eBSV的基因型、eBSV的表达和激活。获得的结果如下:1.用多重结合PCR对23种香蕉材料的附加体病毒进行了检测,发现除云南滑粉和杂粉-1号这两个材料感染了附加体病毒。而其它材料都没有感染附加体BSOLV-GD。这些没有感染BSOLV-GD的材料将用于香蕉eBSV激活的研究。2.将BSOLV-GD序列用BLAST进行同源性搜索后发现来源于长梗蕉的一个细菌人工染色体(bacterialartificial chromosome,BAC)克隆(AP009334)中包含9个与BSOLV-GD同源的片段,并作出了eBSOLV-GD的结构图。分析BAC克隆中eBSV序列与BSOLV-GD序列的碱基替换,在BAC克隆的eBSOLV-GD区域中发现50个核苷酸突变。其中分为21个同义突变(Synonymous Mutation)和24个错义突变(Missense Mutation)。3.为明确香蕉中eBSV的不同的基因型,根据eBSOLV-GD的结构设计引物,采用内源条斑病毒基因型分析的方法对所试材料进行分析。结果表明:只含A基因组的香蕉中不含eBSOLV-GD;含B基因组的香蕉中eBSOLV-GD的基因型可分为7种,部分为感染型的eBSOLV-GD。4.用RT-PCR的检测方法对eBSOLV-GD的表达进行了研究。结果表明粉蕉和大蕉中eBSOLV-GD的片段Ⅱ和Ⅲ能表达,并且粉蕉中eBSV片段表达最强,它的表达量大约是大蕉和香芽蕉的3倍。5.选择5种不含附加体病毒且具有不同eBSOLV-GD基因型的香蕉,经组织培养后,调查香蕉后代条斑病的发病率。No.1广粉-1号和高芭粉蕉的发病率分别达18.0%和16.8%,明显比香牙蕉和大蕉高,但香牙蕉和大蕉的发病率没有显著差异。发病率与eBSOLV-GD的基因型无关,而与香蕉的类型有关。用M-DB-PCR检测发病植株,结果只从粉蕉和大蕉发病植株中检测到BSOLV-GD,香芽蕉中没有检测到BSOLV-GD。引起粉蕉和大蕉发病的原因是由eBSOLV-GD激活产生了附加体病毒。
其他文献
目的:探讨心理护理干预在小儿静脉输液中的实施效果.方法:选取2015年6月-2018年4月于本科室需要进行静脉输液的患儿260例为研究对象并将其随机分为对照组和干预组各130例,对
目的:探讨左西孟旦治疗急性心力衰竭的临床效果.方法:将100例急性心力衰竭患者,随机分为观察组和对照组,各50例.观察组给予左西孟旦治疗,对照组给予多巴酚丁胺治疗.对比两组
目的:探讨利奈唑胺治疗老年重症社区获得性肺炎的临床治疗疗效及对治疗的安全性进行临床观察.方法:采用随机取样的方法对我院自2014年1月至2016年3月收治的老年重症肺炎患者
多效唑对苦荞麦的增产效应(简报)魏太忠,陈学才,余世学(凉山彝族自治州农技站,西昌615000)苦荞麦在现蕾初期,上部枝叶繁茂,根系不发达,根冠比较其它作物低,植株重心偏高。遇风易倒伏,制约着苦荞
宋代时期,众多文人雅士在闲暇之余,往往喜欢参加各种形式的体育活动,或者强身健体、或者修身养性,留下无穷逸事与佳话。探微宋代文人所钟爱的体育活动,便于人们学习和借鉴,增
目的:在乳腺良恶性肿块鉴别诊断中应用超声造影结合时间-强度曲线分析,探析其鉴别诊断价值.方法:选取我院在2015年4月至2016年4月期间所收治的32例乳腺肿块患者作为样本人群,
我出生在猫跳河四级电站,又叫窄巷口电站,风景极美。  我记事从这个电站开始,先是居住环境,后是左邻右舍。印象中,那排油毛毡平房很长,横卧在一个大斜坡上。平房后有条公路,是土路,通前方到河槽。房前的行道和家里的地皮一样,没用水泥硬化。整条行道坑坑洼洼,宽不及一丈,因为走的人比家里多,行道比家里的泥地黑。行道前是个大土坎,很陡。邻居们都用木头在斜坡上悬空搭建厨房,行道显得又细又长。门前有大土坎,打扫卫
期刊
通过对制备材料、酶液浓度、酶解时间、酶解温度、渗透压稳定剂的种类和浓度等因素的实验研究,得到了一套制备指状青霉(Penicillium digitatum)原生质体的有效方法,并在双层
目的:探讨农药中毒的抢救与护理.方法:抽取中大岭南医院急诊科2015年3月—2017年3月10例抢救有机磷农药中毒病例进行讨论分析总结,结果:根据病情程度给予催吐、导泄、洗胃、
苏州精细化工集团公司制服矿尘危害长期以来,硫酸生产中气流带矿尘的难题一直困扰着化工行业,即使采用水洗净化回收矿尘,但也无法从根本上消除回收后的矿尘成为污泥继续污染环境