棘胸蛙驯食调控转录组比较分析

来源 :贵州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ITlogileon
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
棘胸蛙作为我国特有的一种大型食用蛙类,具有肉质细嫩,营养丰富的特点,深受广大消费者和科研工作者的喜爱,从20世纪80年代初,福建、江西等地开始进行棘胸蛙的人工驯养,目前已有近40年的发展历程,然而棘胸蛙规模化养殖却发展缓慢,其主要制约因素之一即饵料问题。棘胸蛙具有显著的食物偏好性,只吃活饵拒绝摄食人工配合饲料,这种现象严重制约了棘胸蛙的规模化推广养殖。研究表明,通过驯食能逐步改变动物食性,诱导部分野生动物摄食人工配合饲料。鉴于此,本研究通过构建棘胸蛙驯食生长模式,驯化一批能够摄食人工配合饲料的棘胸蛙,探究易驯食与不易驯食棘胸蛙的生长性能、消化酶和抗氧化酶活性、并进行转录组测序及驯化相关基因表达分析,进一步开发与驯化相关的微卫星位点。研究结果可为蛙类驯食养殖和后续摄食分子机理探究提供参考价值和理论依据。1、棘胸蛙食性驯化对生长和酶活性的影响采用“以活带动法(驯化期)+以水带动法(巩固期)”相结合的驯食模式,经过两个月的驯食养殖后,筛选的易驯食组与不易驯食组棘胸蛙在体重、体长、头长、头宽、肠长指标上均有显著差异(P<0.05)。其中以体重的变化最大,易驯食组相较最初增加了约3倍,不易驯组比最初时下降36.20%,出现负增长现象。比较易驯食与不易驯食组棘胸蛙消化酶(脂肪酶(LPS)、胰蛋白酶(TRS)和淀粉酶(α-AMS))、抗氧化酶(总超氧化物歧化酶(T-SOD)、过氧化氢酶(CAT))活性及丙二醛(MDA)含量,发现α-AMS在易驯食组的肝、肾、前肠、中肠、后肠的活性均高于不易驯食组(P<0.05)。LPS在不易驯食组肝、中肠的活性显著高于易驯食组(P<0.05),且以中肠中活性最高。TRS在易驯食组的肝、肾、前肠、中肠、后肠的活性均高于不易驯食组(P<0.05),且以前肠中活性最高。T-SOD在易驯食组的前肠、中肠、后肠的活性均高于不易驯食组(P<0.05)。CAT在易驯食组的肝、肾的活性均高于不易驯食组(P<0.05)。MDA在不易驯食组的肝、肾、前肠、中肠、后肠的含量均高于易驯食组,但只有肝、前肠差异显著(P<0.05)。2、棘胸蛙食性驯化相关转录组学分析通过对易驯食与不易驯食棘胸蛙进行转录组测序,共获得78.47Gb有效数据,从头拼接组装得到100,461条Unigene,并有30,092条Unigene得到注释,占All-Unigene的29.9%,这为棘胸蛙驯食机理研究提供了大量序列。通过比对发现,70.34%的Unigene能比对到高山倭蛙(Nanorana parkeri,70.34%)的序列上,其次是牛蛙(Rana catesbeiana,8.13%)、非洲爪蟾(Xenopus laevis,7.45%)和热带爪蟾(Xenopus tropicalis,7.08%)。在易驯食组与不易驯食组脑组织中共发现差显基因(DEG)139个,其中上调基因66个,下调基因73个;肝组织中共发现DEG 1517个,上调基因881个,下调基因636个。将筛选出的差显基因进行GO富集分析,发现在生物过程类别中,趋势差异不同的二级term中有行为、生长、以及节律等;在分子功能类别中,趋势差异不同的二级term中有信号传导、抗氧化能力等,从而揭示棘胸蛙的驯食难易程度可能与上述生物过程密切相关。对易驯与不易驯食DEG进行KEGG富集分析,在脑和肝脏中,各找到10条与食性最密切相关的代谢通路,其中共同的通路有8条,在这所有12条通路中,有6条通路与前人研究报道一致,6条推测可能为棘胸蛙新发现的食性相关通路,这些相关基因及信号通路为研究棘胸蛙的食性分子机制提供了遗传研究基础。3、棘胸蛙食性相关SSR开发与验证分析在100,461条序列中发现32,726个微卫星位点,其中17,308条序列含有SSR位点,10,843(62.65%)得到了注释,可作为SSR标记开发的优先候选基因。其中SSR长度在12bp以上的位点达到17,233个,占所有SSR位点的59.37%,说明棘胸蛙具有中度偏高的片段长度的多态性。通过设定筛选条件,最终筛选出能成功设计引物且与食性相关的微卫星位点127个,并且通过琼脂糖凝胶验证,有39对引物扩增出单一条带,且与预期产物大小一致。此结果为棘胸蛙进一步的食性驯化研究与资源保护提供数据支撑。综上所述,棘胸蛙经驯化后可摄食人工配合饲料。对比易驯食与不易驯食棘胸蛙的生长、酶活特征以及转录组差异情况,挖掘驯食相关功能基因与探索驯食相关的通路,开发驯食相关的微卫星标记,为后续棘胸蛙的大批量驯化与人工配合饲料的开发提供理论依据与技术支撑,也为两栖类的人工驯化养殖提供技术指导。
其他文献
目的 探讨左旋多巴联合综合疗法对屈光不正性弱视儿童和青少年视功能的影响。方法 回顾性分析2020年2月至2021年2月赤峰市第二医院收治的114例屈光不正性弱视儿童和青少年,依据不同的治疗方法将其分为A组(57例,给予屈光矫正疗法、视觉刺激训练、遮盖疗法等综合疗法)和B组(57例,给予左旋多巴联合综合疗法),两组患者均治疗6个月。比较两组患者治疗后临床疗效,矫正近立体视锐度、矫正辐辏范围、矫正分开
公共经济学是专门研究政府经济行为规律的科学,自然涉及新时代中国特色社会主义市场经济、中国经济发展的成功经验等问题,其教学内容与课程思政紧密融合。结合公共经济学的课程性质,探索适合中国情境的公共经济学课程思政建设教学方式,使学生在掌握理论知识的同时,增强“知中国,服务中国”的能力。
历史发展到有汉一代,士人面对不断变化的风云局势做出不同的出处选择,展现出士人政治品格的不同风貌,其对于“诗言志”的理论认识与文学实践也随之丰富。本文从士人角度分析汉代“诗言志”的理论内涵及实践表现,以此二线的起伏为线索梳理“诗言志”观念在两汉社会的变迁,以此为依据将本文论述划分为四个部分。第一章论述士人品格中热诚进取与政以诗礼的一面,也是汉代“诗言志”的勃发阶段。在大一统统治方兴未艾之时,政治思想
随着经济的发展,县城的公共交通路线也越来越多,交通问题也越来越严重,对县城的公交网络特征的研究也越来越重要。文章基于复杂网络基本理论,运用度与度分布、平均路径长度以及平均聚类系数指标,结合贵州省贵阳市开阳县公共交通站点网络数据,确定了网络中重要节点,并运用Gephi软件做出节点图,由此分析得出贵阳市开阳县公交站点网络的一般特征。
近年来,地方本科高校面对新形势,坚持立德树人,在办好思政课程的同时积极开展课程思政建设。对江苏省地方本科高校课程思政建设情况的调研发现,一些地方本科高校课程思政建设存在需要加以解决的问题,主要包括缺少系统性,尚未形成课程思政与思政课程同向同行的大思政格局;课程思政与专业课程相互隔离,没有实现有机融合;教师开展课程思政能力较为欠缺。针对这些问题,做好课程思政建设工作,需要从多方面入手,要做好学校顶层
"航海新时代丝路再出发。"第14届中国航海日到来之际,全国各地围绕航海日活动主题,开展了一系列丰富多彩的庆祝活动,引起社会各界热烈反响,为高质量实现航运现代化、建设交通强国、支撑"21世纪海上丝绸之路"建设营造了浓厚氛围。2018年7月11日,在上海国际客运中心码头,随着一声悠长的汽笛声,"东海救101"轮、"海巡01"轮、072A型大型登陆
期刊
国际贸易理论与实务课程团队秉持“三全育人”理念,依托省级“课程思政”示范课程建设项目,重新设定了在线开放课程建设的思路与目标,进行了教学内容和学习资源规划,充分发挥在线开放课程的资源优势,尝试进行“线上+线下”混合式“课程思政”教学模式,充分放大在线开放课程育人功能。“课程思政”背景下在线开放课程建设宝贵经验为高职院校“课程思政”教学资源建设提供重要借鉴,也是对“课程思政”教学模式的有益探索。
随着社会经济的不断发展,现阶段我国GDP的增长率开始呈现下滑趋势,并且伴随着产能过剩行业的蔓延和中小企业风险的加剧。在这样的环境下,商业银行的不良资产规模以及不良资产率均处于持续上升的态势,导致银行信贷业务趋于保守,并逐渐将发展重心由企业金融转为消费金融。消费金融经历近几年的飞速发展,信贷品种不断丰富,信贷规模不断扩大,已逐渐成为银行最重要的获利来源之一。然而,随着消费信贷规模的增长,出现了超额审
随着城市化进程的不断发展,人们对于现代生活中基于室内位置的服务的需求在日益提升。然而室内定位面临着室内环境场景复杂,干扰多,人员位置变化快等挑战也使得在复杂的室内环境中获得高精度的定位结果一直是研究热点。2016年版的802.11MC协议中,提出了一种新型的可用于室内定位的WIFI-RTT(Round Trip Time)测距技术,其拥有部署成本低,精度高的特点,是近年来室内定位研究的一个热门研究
近年来,随着城市化进程的明显加快,较多地区的县城道路交通管理工作面临着极大的压力。城区路网结构不合理,部分道路存在路面狭窄、功能不健全、平面交叉过于密集等问题;停车场等配套设施不完善,人流、车流的急剧增长和老城区基础设施相对滞后的矛盾日益严重,行车难,尤其是停车难问题严峻;交通出行方式待优化,公交线路未达到全面覆盖,线路和站点设置的便民化程度不高,市民出行的交通工具仍主要依赖私家汽车、摩托车及电动
期刊