论文部分内容阅读
赤斑羚(Naemorhedus baileyi),属于牛科Bovidae羊亚科Caprinae斑羚属Naemorhedus。鬣羚(Capricornis sumatraensis),属于牛科Bovidae羊亚科Caprinae鬣羚属Capricornis。由于种群分布地狭小且种群较小,样本采集困难,故赤斑羚和鬣羚的物种地位一直备受质疑。本研究样本为采自西藏米林地区的24个赤斑羚皮张样本和19个鬣羚皮张样本,以及采自上海动物园的5份赤斑羚毛发样本和2份斑羚的毛发样本。分别提取这些样本的DNA,用不同引物分别扩增Cytb、D-loop和CO1三段基因序列。同时从Genbank下载得到鬣羚属和斑羚属的相关物种基因序列,序列覆盖了鬣羚属的4个物种和斑羚属内的4个物种。利用不同的生物软件分析序列碱基组成,碱基饱和度,以及Kimura双参数遗传距离,并分别使用邻接法和最大似然法构建生物进化树,最后将不同基因的进化树进行合并。实验结果用于分析赤斑羚和鬣羚的物种地位、斑羚属和鬣羚属内其他物种的种间关系、斑羚属和鬣羚属的属间关系,以及两属内物种的进化历史。结果包括以下几点：1.支持赤斑羚在斑羚属以及鬣羚在鬣羚属具有独立有效的物种地位的观点。不支持将赤斑羚和鬣羚归为其他物种的亚种的观点。2.认为斑羚Naemorhedus goral和喜马拉雅斑羚Naemorhedus goral为同物异名。同时,认为长尾斑羚Naemorhedus caudatus和朝鲜斑羚Naemorhedus caudatus raddeanus之间没有达到亚种分化。3.认为鬣羚Capricornis sumatraensis和苏门羚Capricornis sumatraensis为同物异名。同时支持日本鬣羚Capricornis crispus在鬣羚属具有物种地位的观点。4.从联合数据构建的系统进化树分枝的拓扑结构分析,本研究支持将斑羚属和鬣羚属作为两个相互独立的属的观点。5.基于联合数据构建的进化树,本研究推测鬣羚属内物种之间的遗传距离标准为0.075,推测鬣羚属与斑羚属属间遗传距离为0.099。可以为今后针对两属的分类研究提供参考标准。6.从转换颠换比(R)及碱基替换饱和度分析散点图中分析出鬣羚属和斑羚属内物种的进化远没有达到饱和,基因差异程度低,核酸多样性程度低,同时各物种间的进化分歧时间短。