重庆市市属开发类科研院所，作为科技创新体系的重要组成部分，自改制以来在技术创新和科技转化市场发挥了重要的作用。但是，大部分市属科研院所散、小、弱，市场开发能力以及服务经济、社会发展的能力还比较有限。必须从体制上和运行机制上进行全面企业化，才能够帮助市属开发类科研院所实现“二次创业”，大力提升其市场运作能力、科技创新能力和技术服务水平。本论文拟就改制后的科研院所如何建立企业制度和管理构建的问题进行探讨，并以重庆市主要的开发类科研院所为例，就现阶段科研院所如何以市场为导向，以业务为纽带，以现有管理体制为平台，建立现代企业制度和管理构建设计可行性方案。以改制科研院所建立现代企业制度为主题，对科研院所建立现代企业制度的一般理论、法人治理结构及运行机制、管理制度建设等问题进行了深入的研究和探讨。