氨氧化反应是硝化反应的限速步骤,以前的研究一直以为执行氨氧化功能的只有氨氧化细菌这一类群,然而,近期的研究突破了这一认识局限。研究发现,氨氧化古菌也参与着氨氧化过程,并且在许多生境中其作用可能远超过氨氧化细菌。本研究于2011年11月采集了8个不同营养负荷水平水体的水样和底泥,包括南湖、三角湖、南太子湖、蔡甸西湖、后官湖、梁子湖、狮子口水库、马龙水库。通过荧光定量PCR的方法对其中的氨氧化古菌amoA基因拷贝数进行定量,并通过统计学分析各样品间氨氧化古菌丰度的差异性,以期探讨其与营养水平的关系,并分析其丰度的关键影响因子。结果显示每升水样中氨氧化古菌amoA拷贝数为7.80x104～1.34x106,每克底泥氨氧化古菌amoA4.64x104-3.19×105。水样中拷贝数最高的是南湖位点1,最低的是后官湖位点2。底泥中amoA最高也是南湖位点1,最低的为梁子湖位点2。相关性分析显示水样中amoA拷贝数与总氮和氨氮正相关(皮尔森指数分别为0.457、0.469),而与pH、总磷、透明度、叶绿素a不具相关性。底泥amoA丰度与底泥总氮呈极其显著正相关(皮尔森指数为0.667),而与pH、总磷、NH4+-N、有机质、含水率等都不具相关性。