背景及宗旨:数以千记的基因间长链非编码RNA(Linc RNA,一种长链非编码RNA)已经通过全基因组测序在哺乳动物基因组中鉴定出来,并且已显示出在肿瘤生物学过程中关键的调控作用。然而,Linc RNA在食管鳞状细胞癌(ESCC)中的具体作用机制仍不清楚。方法:为了更好地了解Linc RNA在肿瘤发生发展中的作用,我们筛选26个高度保守的Linc RNA,并对来自中国两个不同研究中心的共360对食管鳞状细胞癌及癌旁组织进行了大规模差异表达分析,以确定这些Linc RNA是否与食管癌的发生发展存在关联。结果:我们的数据显示,linc-POU3F3的表达水平在食管鳞癌组织中显著高于相对应的癌旁组织。通过进一步功能及机制研究发现linc-POU3F3能够显著抑制POU3F3基因的转录活性,下调POU3F3的m RNA水平(POU3F3基因与linc-POU3F3在进化过程中始终位置的相对保守)。此外,POU3F3基因的甲基化定量分析结果表明,linc-POU3F3可以调节POU3F3基因启动子的甲基化程度,这也与POU3F3基因在肿瘤中高度甲基化状态的报道相一致。结论:Linc-POU3F3可能通过改变靶标基因POU3F3的甲基化水平从而影响食管癌的发生发展,由此反映出linc RNA可以在食管癌进展过程中起到关键的调节作用。