海南坡鹿(Cervus eldi hainanus)是泽鹿(Cervus eldi)的一个亚种，仅分布于中国海南岛。由于捕猎和生境破坏，海南坡鹿种群数量急剧下降，一度只剩下不到50只。经过30多年的就地与迁地保护，坡鹿种群已经超过2000头。但由于经历了严重的瓶颈效应，坡鹿的遗传多样性有可能很低，抗病能力和生存能力堪忧。　　 MHC(Majior Histocompatibility Complex，主要组织相容性复合体)是脊椎动物的多基因家族，编码多种细胞表面跨膜糖蛋白，呈递抗原多肽至T细胞，从而启动特异性免疫应答反应。哺乳动物Ⅱ类MHC由DQA、DQB、DRA和DRB等多个功能基因组成，编码负责呈递外源性抗原的分子。由于MHC与抗病能力直接相关，所以是反映种群遗传多样性和评估生存潜力的良好指标。　　 本文分离了一只海南坡鹿个体的Ⅱ类MHC功能基因的cDNA全长，为位点分离打下基础。本文分离了2条DRA基因的全长，2条DRB基因的全长，2条DQA基因的全长和2条DQB基因的全长，以及另一条DQB等位基因的一段。经比较与牛、羊等反刍动物的序列高度相似。还通过SSCP带型复原证明DRA和DQA基因的cDNA都已经拿到。另外还获得了DRA和DQA基因的2号和3号内含子。