改革开放以来,随着市场经济体制改革的不断深入和我国对外开放力度的不断增强,我国制造业的企业格局发生了重大变化。我国利用外资主要集中在制造业领域,占总体利用外资规模的60%-70%,并呈持续增长的趋势;而制造业中不同所有制内资企业的比重也发生了重大变化。国有企业占制造业产出的比例已从1980年的76%,下降到了目前的不足30%。与此同时,民营企业取得了长足的发展。企业格局的优化使得我国制造业的经济运行效率得到了大幅度提升。然而,经济活动的高投入、低效率始终是我国制造业增长过程中的突出问题。因此对我国制造业生产效率现状及提升途径的研究就显得尤为重要。文章在对各种主要的效率分析方法进行比较研究和分析的基础上,运用数据包络分析方法分别对制造业28个行业内资企业、外资企业1999-2006年历年的技术效率、纯技术效率、规模效率以及此期间的全要素生产率指数及其构成情况进行了实证分析。结果表明,我国制造业内外资企业在绝大多数行业中均为达到“技术有效”和“规模有效”;内资企业生产效率相对较高的行业集中在劳动密集型产业和垄断程度较高的行业,而外资企业生产效率较高的行业集中在资本、技术密集型产业及行业进入壁垒较高的产业;我国内外资企业在制造业各行业中的Malmquist指数呈现出上升的趋势,两类企业全要素生产率的提高都主要依靠技术进步水平的提高;我国内资企业在大多数的资本及劳动密集型行业中的TFP增长速度大于外资企业,内资企业在技术要求较低的劳动及资本密集型行业中的生产效率水平同外资企业之间有追赶效应存在的可能性,但是内外资企业在技术密集型行业中生产效率差距在不断扩大。最后,在此基础上提出了相应的政策建议。