当前,经济发展和环境污染之间的矛盾日益尖锐。排污权交易作为一项新的环境管理经济政策在全球范围引起高度的重视。美国的排污权交易实践第一次将经济激励运用于大气污染源及河流污染源管理,并取得了显著的成效。近年来,欧美的许多环境经济学家已开始探讨建立国际排污权交易体系,以控制温室效应和臭氧层的破坏。而排污权交易制度在我国还处在起步阶段,尤其是涉及到水污染方面。因此,对于该制度的理论和应用研究显得尤为重要。本文以水污染物总量控制为背景,以环境经济学和运筹学的理论和方法为研究工具,对排污权交易制度的若干问题进行了一些理论分析和应用研究。首先分析了我国水污染的严峻形势,提出环境管理需要经济手段。然后运用环境经济学的理论分析了排污权交易和总量控制的理论基础,进而分析了在我国实行排污权交易的可行性和必要性。然后根据水污染的特点,分析了水污染物排污权交易制度建立需明确的基本问题,并进行了水污染物排污权交易体系的框架设计。最后重点分析了在水污染物排污权交易制度中排污总量的确定方法、初始排污权的分配、排污权交易体系的运行和监督管理等方面的问题。在初始排污权分配问题中,结合水污染特征提出了公平条件下水污染物排污权初始分配模型,并通过实例论证了该模型的可行性和优越性。