长链脂肪酸在哺乳动物体内具有广泛的生理功能,特别是在生物膜的形成和动态特性维持中发挥着不可或缺的作用。脂肪酸转运蛋白1(fatty acid transport protein1, FATP1)和膜脂肪酸结合蛋白(Plasma membrane fatty acid-binding protein, FABPpm)是细胞质膜蛋白,在心脏、肝脏、肌肉和小肠等脂肪酸代谢活跃的组织器官中均有表达。已有研究表明,FATP1和FABPpm在长链脂肪酸的摄取和代谢调节中发挥着重要作用,但在反刍动物乳腺中的作用机制研究较少。本研究以中国荷斯坦奶牛作为研究对象,利用RT-PCR结合RACE技术对奶牛乳腺脂肪酸转运蛋白基因FATP1和FABPpm进行全长cDNA克隆,并对其cDNA和氨基酸序列及蛋白结构进行了生物信息学的分析。结果表明：奶牛乳腺FATP1基因cDNA全长3459bp,开放阅读框为1941bp,编码646个氨基酸,5’非编码区长243bp,3’非编码区长1275bp；FABPpm基因cDNA全长1700bp,开放阅读框为1293bp,编码430个氨基酸,5’非编码区长108bp,3’非编码区长299bp; FATP1基因编码的蛋白相对分子质量为71.0238kD,理论等电点为8.83；FABPpm基因编码的蛋白相对分子质量为47.5135kD,理论等电点为9.19；二、三级结构预测表明两种蛋白含有较多的a-螺旋、延伸链和无规则卷曲；对其氨基酸序列进行同源性分析发现,中国荷斯坦奶牛与已知的哺乳动物FATP1氨基酸序列同源性在88%～94%之间,FABPpm氨基酸序列同源性在93%-96%之间；系统进化树分析表明,中国荷斯坦奶牛与猪的亲缘关系最近。克隆奶牛乳腺脂肪酸转运蛋白基因FATP1和FABPpm全长cDNA序列为进一步研究其亚细胞定位和脂肪酸转运功能奠定了基础。