社区泌尿系感染大肠埃希菌耐药和分子流行病学研究

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目的:大肠埃希菌是常见的机会性致病菌,可引起泌尿系感染、血流感染和脑膜炎等。近年来大肠埃希菌对临床常用抗生素的敏感性降低,增加了临床抗感染治疗的难度。因此,本课题旨在通过对泌尿系感染的大肠埃希菌进行流行病学调查,探索社区泌尿系感染大肠埃希菌中整合子的分布及其与系统发育群、细菌耐药性的关系,并对大肠埃希菌携带的ESBL基因和PMQR基因进行分析。方法:收集2015年11月至2018年12月非重复分离自安徽理工大学附属奉贤医院肾内科门诊就诊患者尿液样本的大肠埃希菌152株,采用Phoenix 100全自动微生物分析仪进行细菌鉴定及药敏分析。PCR筛查第1、第2、第3类整合酶基因、整合子可变区和各分离株的系统发育群,通过测序分析确定可变区启动子类型及基因盒组合。同时,PCR筛查大肠埃希菌所产生的ESBL基因和PMQR基因,分析第1类整合子、ESBL和PMQR基因与系统发育群、细菌耐药性的关系。结果:152株大肠埃希菌对氨苄青霉素的耐药率为70.39%,对其他抗菌药物的耐药率均低于40.00%。152株大肠埃希菌系统发育群以B2群和D群为主。152株大肠埃希菌中65株(42.76%)检测到第1类整合酶基因intI1,共检出68个第1类整合子,8种基因盒组合和14种耐药基因盒,其中基因盒组合dfrA17-aadA5检出率最高(35/68),12株intI1阳性菌株可变区扩增失败。第1类整合子可变区中共检出5种可变区启动子,相对较弱的PcH1检出率最高(53/68),同时检测出基因盒组合arr-2-cmIA5-blaOXA-10-aadA1。65株intI1阳性菌株中各系统发育群以B2群和D群为主。4株(2.63%)检出第2类整合酶基因intI2,其可变区基因盒组合均为dfrA1-sat2-aadA1。未检出第3类整合酶基因。intl1阳性菌株对临床常用药物耐药率高于intI1阴性菌株。152株大肠埃希菌共102株携带ESBL基因,包括blaTEM-1、blaCTX-M-55、blaCTX-M-14、blaCTX-M-27、blaCTX-M-65、blaOXA-1,其中7株同时携带blaTEM-1和blaCrX-M-27、9株同时携带bIaTEM-1和blaCTX-M-14、1株同时携带blaTEM-51和blaTME-1未检出blaCTX-M-2、blaCTX-M-8、blaCTX-M-25和blaSHV ESBL 基因型。152 株大肠埃希菌中 23 株携带 PMQR 基因,包含qnrD,qnrS,oqxA,oqxB,aac(6’)-1b 和 aac(6’)-1b-cr,未检出qnrA、qnrB、qnrC、qepA基因。152株大肠埃希菌中6株携带多种(≥2种)PMQR组耐药基因,17株同时携带ESBL和PMQR耐药基因,44株未检测出ESBL和PMQR耐药基因。结论:社区泌尿系感染中分离到的大肠埃希菌对抗菌药物具有较低的耐药性,系统发育群B2群和D群为主要发育群。社区泌尿系感染中分离到的大肠埃希菌第1类整合子与细菌耐药性密切相关,其携带的第1类整合子可变区启动子以弱启动子为主。大肠埃希菌中检出基因盒组合arr-2-cmIA5-blaOXA-10-aadA1。blaTEM-1和blaCTX-M-14是本研究中大肠埃希菌ESBL基因的主要型别。PMQR基因在社区泌尿系感染的大肠埃希菌中具有较低的流行率。图[4]表[14]参[59]
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