太湖是我国第三大淡水湖，随着经济社会的高速发展，太湖水环境受到严重污染，质量呈现每10年下降一个等级的发展趋势。掌握湖区各区域的营养物含量、水环境机理，并进行模拟预测，对于遏制太湖水体持续恶化、减轻湖泊富养化程度具有一定的指导意义，为水环境治理工作提供技术支撑和决策支持。　　本文收集太湖湖区及周边的实测数据，并且考虑引江济太工程调度对湖区水动力及水生态环境的影响，选用美国弗吉尼亚州海洋研究所研发的环境流体动力学(EFDC)模型建立湖区二维生态动力学模型，模拟太湖水环境随时间、空间的变化过程，并进行率定、验证和归纳分析。　　本文主要研究成果有:(1)概化太湖环湖出入流边界，以15条大流量河道表征太湖边界，模拟效果良好，概化合理;(2)考虑引江济太工程对湖区水体的影响，在风生流基础上加入吞吐流模拟太湖湖流，结果表明引江济太工程对太湖湖流影响很小，并未明显改变太湖水体环境;(3)太湖二维水动力学模型的模拟精度高，水位模拟的日平均偏差在2cm以内，水温模拟的日平均误差在2℃以内;(4)太湖二维水质、生态动力学模型的模拟输出结果表明:溶解氧、化学需氧量的模拟精度最高，氨氮、总磷、叶绿素a的模拟效果良好，总氮的输出模拟除夏季误差偏大外，其他时段模拟精度较高;(5)根据水质、生态相关参数的调试工作，总结出各营养物质的敏感参数，以及多个参数之间的关联性。　　从本文研究结果可以得出:　　(1)太湖湖区面积大，不同区域流速、温度、底泥释放量均不同，导致不同区域的营养物质浓度之间具有显著的空间差异，水生态环境相差较大;　　(2)湖区内藻类含量较低的区域与总氮、总磷浓度没有明显的线性相关性;而藻类爆发的区域与总磷浓度有明显的线性相关性，与总氮浓度也有较明显相关性。导致湖区藻类爆发的关键因素是总磷浓度，总氮次之。藻类生长的最适总磷浓度为0.15-0.35mg/l，总氮浓度为2-2.5mg/l，氮/磷比为5-15;　　(3)当湖区中总氮、总磷的浓度相对较低时对藻类生长起促进作用，但当总氮、总磷浓度达到一定值后又会抑制藻类生长。所以在治理湖区富营养化问题上，不能仅考虑氮、磷含量降低，还应从生态角度探寻治理方法;　　(4)基于EFDC模型建立太湖湖区水动力、水质-生态模型，水动力模型模拟精度高，水位模拟误差在0.62％，水温模拟误差在18.5％以内，水质-生态动力学模型的模拟误差都在30％以内，表明用EFDC模型模拟太湖水环境具有一定可行性，可为太湖治理、防治等工作提供技术支撑和决策支持。