Rhodococcus sp.R04水解酶BphD的定向进化及其突变酶的性质研究

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BphD(2-羟基-6-氧-6-苯基-2,4-己二烯酸水解酶)是一种多氯联苯微生物降解途径中的关键酶。它负责催化2-羟基-6-氧-6-苯基-2,4-己二烯酸(2-hydroxyl-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoicacid,HOPDA)C-C键的断裂,生成2-羟基-2,4-戊二烯酸(2-hydroxypenta-2,4-dienoicacid,HPD)以及苯甲酸。近年来,对该水解酶结构、功能及催化机制的研究已经成为该领域研究的热点。   本文以酶切质粒获得的bphD基因作为源基因,利用体外定向进化技术对其进行改造,以获得性能更为优良的产酶菌株。采用DNAshuffling技术成功构建了BphD突变文库,并利用96孔板活性筛选法对该突变库进行初步筛选,最终获得了6株酶活力较高的突变株:E.coliDH5α/pBV220-bphD30、E.coliDH5α/pBV220-bphD41、E.coliDH5α/pBV220-bphD45、E.coliDH5α/pBV220-bphD48、E.coliDH5α/pBV220-bphD49和E.coliDH5α/pBV220-bphD53。序列分析发现,在BphD一级结构序列中,Q20-R是突变频率最高的位点,而突变较为集中的区段为氨基酸序列的1-20及40-120。   将BphD及突变酶的基因分别克隆到表达载体pET21a中。表达产物经QSepharose离子柱和PhenylFF疏水柱两步纯化,得到了纯度较高的酶。在此基础上,对BphD及突变酶的比活、热稳定性及稳态动力学参数进行了比较研究。结果表明,这6株突变酶的热稳定性与野生型基本一致(T1/230min约为62.5℃);突变体30#、41#、45#、48#、49#及53#对底物的亲和力较野生型分别提高了19.31、2.8、3.04、2.14、2.3和1.34倍,转化效率分别提高了16.56、2.26、3.53、2.95、2.84和1.56倍。   我们对该水解酶进行了定点突变(Pro-aa),并研究了脯氨酸突变对BphD的表达量、酶活性、热稳定性、圆二色谱及荧光光谱的影响。结果表明,突变酶P43G、P145A、P163A、P214E、P241A、P253L和P43G/P163A的可溶性表达量均较野生型的低。脯氨酸突变酶的酶活均较野生型的低,其中突变酶P43G和P43G/P163A酶活分别降低了4.23和28.15倍。突变酶P43G/P163A的T1/220min仅为51℃,较野生型降低了13℃;其次是突变酶P241A、P145A、P253L、P43G、P161、P163A、P179Q及P214E,较野生型分别降低了9、6、6、4、3、3、3和1℃。突变体的圆二色谱(CD谱)分析表明:与野生型相比,突变体的二级结构没有发生改变;突变酶P43G/P163A、P241A、P253L、P161、P163A、P179Q、P214E、P145A及P43G的热变性中点温度(T1/2CD)分别较野生型降低了22、18.5、14、13、13、13、11、8.5及4℃。突变体的荧光光谱分析表明:脯氨酸突变后蛋白质的分子构象发生了变化。证明了脯氨酸突变影响了BphD的正确折叠、酶活性、热稳定性(T1/220min)、热变性中点温度(T1/2CD)及其分子构象;而将脯氨酸回复突变后,其酶学性质也会得到相应的恢复。可见,脯氨酸对维持联苯水解酶的结构和稳定性具有重要的作用。
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