棉花是我国最重要的经济作物，随着杂交棉花在我国的大面积推广种植及市场经济的发展，加强种子检验，特别是种子真实性和品种纯度检测，对棉花生产至关重要。本文在前人研究的基础上，应用SSR标记技术，对当前生产上广泛应用的两个代表性杂交棉品种进行了鉴定、筛选和调查，并获得如下主要实验结果:　　1.通过筛选16对品种鉴定的SSR标记引物，建立了亲本未知状态下的棉花杂交种纯度鉴定方法:利用NAU1186引物鉴别816杂种F1的方法;利用引物NAU2190及引物NAU1269进行分子标记鉴定，同时对亲本带型材料结合观察其农艺性状，以鉴别鄂杂棉10号杂种F1的方法。　　2.应用建立的杂交种纯度鉴定方法，对瑞杂816和鄂杂棉10号两个棉花主栽杂交种进行了纯度鉴定，供测的瑞杂816种子纯度为93.8％，鄂杂棉10号的种子纯度为89.4％。　　3.统计不同类型棉花材料的产量相关性状，纯瑞杂816比检测的杂交种平均结铃多4.7％，理论产量高6.8％;纯鄂杂棉10号比检测的杂交种平均结铃多6.1％，理论产量高7.5％，因而获得种子不纯导致减产的直接证据。　　4.利用苯酚在65℃以上的温度条件下可与水以任意比例互溶的特性，建立了热酚CTAB法用以提取棉花种子等器官中的DNA，质量和得率均较高。　　本研究所获得的结果可用于2个当前生产上主栽的杂交棉花品种的鉴别和纯度检测，也为其他品种建立纯度鉴定方法提供了借鉴。