【摘 要】
:
动植物的许多重要经济性状以及人类复杂疾病均属于复杂性状范畴。基于混合线性模型的关联分析方法可以精确预测复杂性状的遗传结构,有效剖析其中的遗传机理。本课题组提出的混合线性模型方法适用于全基因组关联分析,并且研制了基于GPU计算的QTXNetwork软件,包括三个功能模块:QTL分析(QTLNetwork),全基因关联分析(QTS)和多组学关联分析(QTT)。然而生物学软件的发展远远落后于算法,现有的
论文部分内容阅读
动植物的许多重要经济性状以及人类复杂疾病均属于复杂性状范畴。基于混合线性模型的关联分析方法可以精确预测复杂性状的遗传结构,有效剖析其中的遗传机理。本课题组提出的混合线性模型方法适用于全基因组关联分析,并且研制了基于GPU计算的QTXNetwork软件,包括三个功能模块:QTL分析(QTLNetwork),全基因关联分析(QTS)和多组学关联分析(QTT)。然而生物学软件的发展远远落后于算法,现有的生物计算软件普遍采取传统的架构模式,都不具备扩展性和高可用性,只可单用户单线程运行,配置复杂,用户操作难度大,影响了方法的推广和使用;同时,随着生物技术的发展,生物数据量的指数级增长使得现有软件的计算复杂度增大,单机性能无法快速扩展算力、数据离线拷贝等问题,使得软件使用更加复杂,计算成为生物研究的主要瓶颈。针对该问题,本课题设计一种容器化上云方案,开发混合线性模型复杂性状关联分析相关工具云平台,方便用户远程使用云平台的弹性可扩展运算能力,降低了GPU等计算资源分析工具的使用门槛,提高了计算分析效率和计算速度。本课题构建云平台包含Iaa S资源层,Paa S平台层和Saa S服务层,Iaa S主要通过Starling X实现,详细介绍了Paa S层Kubernetes构建过程,以及Saa S层微服务和容器等技术。将QTLNetwork,QTS_Raw,GMDR,QTS_GPU,QTT_GPU五种单机分析工具云原生化,构建Saa S层web服务应用QTXCloud(http://ibi.zju.edu.cn/QTXCloud/)。通过测试表明,基于容器的混合线性模型复杂性状分析云平台具有较好的高可用性,极大减少了用户使用的复杂性,提高了物理资源的利用率。另一方面,云平台具有便捷的扩缩容能力,可弹性提供计算资源,同时利用微服务,平台功能均可以插件形式进行增加或剪裁。
其他文献
集团公司一般来说名下都有着很多的子集团公司,且这些子集团公司涉及的领域可能是多个不同的方面,因此各个子集团公司在进行资金管理时有所不同。但集团企业务必要实行资金的集中管理,这对于企业长期发展的战略要求以及降低财务成本等方面起着重要的作用。但在实际的操作过程中,集团公司的资金集中管理还存在着一些问题,本文就将对面临的一些问题及应对策略进行简单分析介绍。
人与自然和谐共生的绿色发展理念已成为新时代的价值取向,构建以国家公园为主体的自然保护地体系将新时代生态文明建设的重要突破口。随着自然保护地建设进入治理体系改革与机构整合重组阶段,保护地治理模式向着职能有机统一的大部制体制推进,理顺自然保护地治理中政府间职能的纵向配置将成为重要议题。建立起从中央到地方分级的自然保护地管理体制,解决好自然保护地治理中的央地事权划分问题,具有重要意义。研究通过自然保护地
对于企业来说,资金集中管理直接影响到企业的进一步发展,目前在我国不同企业中针对资金集中管理所提出的要求也是不一样的,这就造成我国集团企业资金集中管理呈现出差异化的效果。在集团企业中将资金进行科学合理的整合管理,不仅能够明显提升企业资金集中管理的最终效果,还有利于集团企业的健康可持续发展。本文主要从集团企业资金集中管理存在的利与弊出发,分析如何对其进一步进行优化。
固相萃取前处理是HPLC分析方法的重要环节,表面分子印迹技术在HPLC前处理中有着广泛的应用。聚多巴胺(PDA)制备方法简单、活性基团多,是分子印迹聚合物的理想载体。本文基于聚多巴胺聚合制备了Fe3O4@PDA@MIPs和Fe3O4@PDA@Ti O2@MIPs两种磁性表面分子印迹聚合物,分别考察了其萃取水体中残留喹诺酮类药物(FQs)的性能。主要研究结果如下:(1)以磁性Fe3O4为磁性内核、聚
目的:研究中药药枕治疗100例社区高血压病的疗效。方法:选取本社区服务中心于2021年3月至2022年3月收治的社区高血压病患者100例,按照随机数字表方法分为对照组(50例)和观察组(50例),对照组社区高血压病患者采用药物治疗方法,观察组社区高血压病患者采用中药药枕治疗方法。结果:观察组社区高血压病患者临床治疗总有效率高于对照组(χ~2=8.846,P<0.05)。观察组社区高血压病患者治疗后
我国建筑业工业化已经发展到了新的阶段。作为建筑业建筑模式的新模式,装配式建筑在满足国民经济、建筑环境和社会效益等方面社会发展需要的前提下,更符合国家智能建造和建筑工业化的要求。仓顶结构结构对称,适宜应用预制装配式方法进行建造。目前国内外关于装配式仓储类建筑仓顶结构的研究主要集中在仓顶结构的建造技术和板缝连接方式上。装配式仓顶结构与传统仓顶结构不同,板缝构造对结构性能存在较大的影响。板缝的存在使得结