【摘 要】
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目的:利用TCGA数据库资源,探索与直肠癌发病相关的潜在关键基因、信号通路、探寻关键基因的表达与预后的关系,并寻找可作用于关键基因靶点的靶向药物。实验方法:本研究利用TCGA数据平台（https://portal.gdc.cancer.gov/）下载167例直肠癌组织和10例癌旁正常组织的基因表达数据和相关临床数据,根据|log2（fold change）|>2、P值<0.05的筛选标准,筛选16
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目的:利用TCGA数据库资源,探索与直肠癌发病相关的潜在关键基因、信号通路、探寻关键基因的表达与预后的关系,并寻找可作用于关键基因靶点的靶向药物。实验方法:本研究利用TCGA数据平台（https://portal.gdc.cancer.gov/）下载167例直肠癌组织和10例癌旁正常组织的基因表达数据和相关临床数据,根据|log2（fold change）|>2、P值<0.05的筛选标准,筛选167例直肠癌组织标本与10例癌旁正常组织的差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs）,并且对DEGs进行了GO基因富集和KEGG通路富集分析,继之利用STRING数据库构建差异表达基因的蛋白-蛋白相互作用网络（protein-protein interaction,PPI）,然后利用Cytoscape内置的分子复合物检测法MCODE（Molecular COmplex Detection）插件对DEGs进行了模块分析,得到12个关键基因,利用R软件的Survival包完成了关键基因的生存分析,最后选择预后相关的关键基因进行基因-药物相互作用分析,探索现有药物可能作为针对关键基因的靶向药物。结果:本研究最终筛选出了2235个DEGs,其中包括表达上调基因1120个,表达下调基因1115个;5个潜在的癌症通路:神经活性配体-受体相互作用信号通路、昼夜节律信号通路、c AMP信号通路、c GMP-PKG信号通路、钙信号通路,12个关键基因:PPBP、SAA1、GNG2、GNG3、GNG8、CASR、LPAR1、GNG4、GNGT1、AGT、PENK、GNG7。生存分析提示CASR低表达水平可能与直肠癌患者预后不良有关。通过基因-药物相互作用分析得到一种现有的药物西纳卡塞（CINACALCET）,可能成为CASR的靶向治疗药物,CASR有希望成为直肠癌治疗的靶基因。结论:基于TCGA数据库挖掘直肠癌5个潜在癌症信号通路及12个关键基因,这将有助于进一步了解直肠癌发生发展的过程,CASR有可能成为直肠癌潜在的治疗靶点及预后标志物,该基因与现有药物西纳卡塞（CINACALCET）药物相匹配,西纳卡塞有可能成为治疗直肠癌的靶向药。
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