近年来，我国的保税区发展所面临的外部环境发生了很大的变化，企业现有的内部管理制度和流程己经不能适应企业发展的要求，对企业进行业务流程再造势在必行。本文通过调查、访谈等方法进行研究，采用定性与定量相结合、量化分析与案例分析相结合的方法,对我国保税区物流的现状以及流程再造方法进行了系统的研究。文章首先回顾了相关的研究综述，涉及的理论主要有三个方面，包括现代物流管理理论、业务流程再造以及流程再造与企业物流管理的相互关系。文章的第三章主要是对我国保税区物流业务的现状进行分析，包括基本的状况、物流业务的基本流程和各个流程的主要内容、以及各流程中存在的问题。第四章介绍了基于流程再造的快速响应运作（敏捷物流运作），分析了要提高物流系统的响应速度而需要采取的相关措施。以此为基础，第五章设计了保税区物流业务流程再造的基本方案，并分析了支撑方案实施的相关措施。