猪ETEC F4受体相关基因及其相关SNP筛选的研究

被引量 : 0次 | 上传用户:a6443064
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本实验首先采用体外黏附表型检测方法检测了大约克和沙子岭初生仔猪F4三种血清型的黏附型,以期发现其遗传差异性。并从小肠上皮细胞提取总RNA用于下一步的试验,即采用δ差异显示方法寻找与ETEC F4黏附表型相关的基因。并通过筛选与受体相关的SNP,进一步研究相关基因与受体的关系。主要研究结果如下:1.体外黏附测定结果表明,F4 ab黏附素对大约克猪和沙子岭猪均黏附强烈,而F4ac则表现为不黏附。二个品种中均存在较高频率的F4abR~+-acR~-。ad黏附素对沙子岭猪的黏附较强烈(0.400),而对大约克猪并不强烈黏附(0.242)。上述结果也暗示猪F4 ab受体和ac受体存在较强的连锁而与ad受体并无此关系。2.本实验采用在δ差异显示法共检测到67条差异片段。在F4 ab黏附差异带检测中,检测到22条差异条带,其中有13条在黏附型样品中特异表达,9条在不黏附型样品中特异表达。在F4 ac黏附差异带检测中,共检测到21条差异条带,其中有13条在黏附型中特异表达,8条在不黏附型样品中特异表达。在F4 ad黏附差异带检测中,共检测到24条差异条带,其中有13条在黏附型中特异表达,11条在不黏附型样品中特异表达。3.67条δ差异片段的再扩增PCR中,有7条差异片段没能实现特异性扩增,没作进一步分析。在60个再扩增差异片段中,,Northern blot结果表明有7个差异片段表现为假阳性。找到了53个阳性差异片段,阳性率为88.3%(53/66)。4.克隆载体送测序公司测序后,到NCBI网站进行BLAST比对,本试验共测序了30条片断,其中比对结果有高同源性(>85%)且同源的长度大于60个碱基的片断有7条,有同源性但低于85%或同源的长度较短的片断有12条,其余11条为新基因片断。本试验将其中20条EST登录到GenBank中,登录号分别为DQ217772,EC268686,DW286736-2867939,EB739624-739627,和EE392468-392477。BLAST结果表明,F4 ab黏附差异带13,与agouti signaling protein(ASIP)有90%(111/123)的同源性;,F4 ac黏附差异带3,与人ATPase,Ca++ transporting,plasma membrane 1(PMCA 1),有91%(239/260)的同源性。F4 ad黏附差异带9,与glycosylinositolphohatidyl anchor 1(GPI 1)有91%(216/237)的同源性。综合同源比对的结果和对基因功能的了解,选择了ASIP、PMCA 1和GPI 1基因分别为F4ab,ac和ad受体的相关基因,但并不排除其它基因也对于受体的表达有着一定影响。5.对于三个基因,分别设计了4对引物,筛选与受体相关的SNP。结果表明:5.1对于ASIP基因,结果经同源比对后发现,其中由引物1扩增产物在485碱基处,所有黏附型个体的碱基均为G,而所有不黏附型个体的碱基均为A,在第619碱基处,所有黏附型个体的碱基均为A,而所有不黏附型个体的碱基均为T。可见这二个位点的SNP很可能是影响黏附性,也就是影响F4ab受体有无的位点。5.2对于PMCA 1基因,测序结果经同源比对后发现,其中由引物2扩增产物在142碱基处,所有黏附型个体的碱基均为A,而所有不黏附型个体的碱基均为T。可见这个位点的SNP很可能是影响黏附性,也就是影响F4ac受体有无的位点。5.3对于GPI 1基因,结果表明,引物2扩增产物在第242、243碱基位置,所有F4 ad黏附型个体均为AT,而所有不黏附型个体均为TG。可见这个位点的SNP很可能是影响黏附性,也就是影响F4 ad受体有无的位点。5.4而在这3个基因其它位置,虽然发现一些SNP,但这些SNP都与黏附性没有明显的相关性。因此不予考虑。
其他文献
排尿障碍是指排尿量、排尿次数等出现障碍的统称,包括多尿、尿频、少尿、无尿、尿失禁、尿潴留、尿痛、尿急、排尿困难等。临床上多种疾病均可导致排尿障碍,表现各异。笔者在
随着我国国家治理体系和治理能力现代化建设进程及政府机构改革、财政体制改革步伐的加快,行政事业单位内部控制建设日益提速,各单位已基本建立内部控制规范,内部控制建设显著改善了单位内部管理水平和各项职能的履行。但由于行政事业单位的特殊地位及行政职能监管的不足,内部控制依然存在诸多问题。政府审计由政府审计机关实施,具有揭示、抵御、改进和预防等功能,通过发现问题、强化整改、信息公开等路径促进行政事业单位内部
从当今世界发展看,科技、教育已经成为社会发展的主要推动力量,教育的重要作用主要表现在高等教育层面,大学作为承担高等教育重任的组织机构具有重要的地位和作用。透过当今时代
随着改革开放和社会主义市场经济的发展,大学生的思想观念、行为方式呈现出复杂性和多样性,大学生的道德状况不容乐观,行为失范现象日益严重,这给新时期高校道德教育工作带来了前
我国破产法中规定了别除权中止制度,但权利的保护和限制都有待进一步完善。限制体现于担保物权的暂停行使,但立法未涉及和解与清算程序。权利的保护表现在确保担保物权的优先
独立学院是在中国高等教育大众化蓬勃发展的进程中应运而生的新事物,2001年创办的昆明医学院海源学院,成为云南省唯一一所医学类本科独立院校。2009年成立的信息管理与信息系
社会稳定是每一个国家发展进步的首要前提。没有稳定就没有发展。在发展中维护社会稳定是世界上每一个国家都必须直面、无法回避的现实问题。社会稳定是一个系统,是政治稳定、
绘画是造型的艺术,是以符号创造审美意象来传达创作主体对审美客体的审美情感的,意象是物化的情感符号。在不同的文化语境下,绘画意象呈现出不同的审美特征。西方艺术家以科
近年来,轮胎行业发生了重大的结构调整:传统的斜交轮胎生产成功转向了子午线轮胎生产。子午线轮胎生产技术的关键是实现橡胶-钢丝的良好粘合,间苯二酚系列粘合剂是子午线轮胎生
<正>在从战略到战术、从布局到竞争的发展过程之后,我国智能家居产业去伪存真、包容并蓄,逐步彰显出未来科技行业的发展趋势。比尔·盖茨曾说过:"在不远的未来,没有智能家居