基于SVM和GA混合算法的基因芯片特征基因子集选取研究

来源 :吉林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ydahu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
基因芯片是生物信息学领域迅速发展起来的一项高新技术。基因芯片的出现为基因诊断和基因治疗提供了很好的前提条件和可能性。对基因芯片技术的实际应用是通过对实验所获得的表达谱数据集进行分析研究来实现的。基因芯片表达谱数据特征基因子集选取问题是基因芯片技术的挑战性课题之一。本文在算法上主要研究了一种基于SVM和GA混合算法的基因芯片数据特征基因子集选取方法。首先利用最小二乘支持向量机分类器按照基因的一定的显著性水平,通过计算基因的重要程度,并根据分类准确度提取出包含若干特征基因的子集,滤掉大部分与疾病类别无关的基因。然后采用改进的遗传算法,根据所选特征对分类的贡献程度对初选的特征基因做进一步特征基因的选择。最后,利用支持向量机作为外部分类器对所选的特征基因子集进行评价。本文将算法用于基因芯片技术的两个公认的数据集,做了实际测试,对选出的不同子集大小、不同遗传终止代数、不同特征基因个数下的结果分别进行了评价并与其他已有应用的算法的实验效果进行了对比,取得了较好的效果。
其他文献
<正>日本乐天,是一家神奇的公司。在它身上,可以打下很多个时髦的关键词:产融结合,互联网金融,生态,第三方支付,等等。用通俗的语言来说,它的商业模式等于"平安+阿里",或者,
由于自适应编码调制技术在宽带无线网络中对于频谱利用率的改善和数据速率的提高方面显现出很强的能力,因此本文针对刚提出一项CT-TCM技术,将其和HARQ技术结合起来,设计出一种自
砷化镓(GaAs)金属—半导体场效应晶体管(MESFET)是一种重要的GaAs器件,广泛的应用于无线通讯、信息技术和相控阵雷达等众多领域。栅漏击穿电压(BVgd)是GaAs MESFET的重要性能指标
本文以Halliday的系统功能语法和Kress&Van Leeuwen的视觉语法框架为理论基础,通过对获得2009年奥斯卡最佳影片的《拆弹部队》的电影海报进行了社会符号学分析,文章通过解读
小微企业在我国经济中占有重要地位,但其融资难题始终未得到根本解决。城市商业银行对小微企业的融资支持有着其他金融机构不可比拟的先天优势,同时也对自身的发展有很大帮助
嵌入式计算机集成度高,功耗小,实时处理能力强,在工业控制领域应用广泛。本文主要介绍如何设计基于嵌入式计算机的激光标刻控制系统,包括PC/104总线和PC/104-plus总线两种控
目的了解京郊乡村医生收入现状及其影响因素,分析乡村医生补偿机制存在的问题,提高乡村医生服务积极性。方法通过统计描述、多元线性回归分析等统计学方法;研究乡村医生收入现状
深刻蚀凹面衍射光栅是未来更小信道间隔、更多信道数波分复用器的首选方案。论文针对器件若干设计问题进行了研究,包括光栅基本结构的确定、平顶频谱响应设计、矢量模拟方法
内部控制作为财务管理中的核心组成部分,其控制质量还会影响到财务工作的效能以及企业的整体财务状况。本文主要就基于企业财务管理的会计内控策略进行了探究分析。
重返"文学性",即重返其诞生的特定历史文化语境,检视其内涵、意义及问题。在历史转折与文化复兴的俄国"白银时代",艺术尤其是诗歌的空前繁荣,大大激发了俄国文学研究的发展和要求