目的：　　寻找与评价新的鉴定人型结核分枝杆菌(MTB)的分子靶标，基于该分子靶标建立实时荧光定量PCR检测方法。　　方法：　　通过生物信息学软件比对细菌全基因组，发现一个特异存在于MTB基因组中的DNA片段(Mycobacterium tuberculosis specificsequence，mtss);针对该DNA片段，设计PCR引物，在266株微生物及人脐静脉细胞中进行检测;通过与传统生化及其它核酸靶标16srDNA、IS6110、mtp40鉴定结果的比较，评价该片段的鉴定效能。基于该片段良好的鉴定效能，建立实时荧光定量PCR的检测方法。　　结果：　　特异性引物(Mtss1，Mtss2)对应的扩增序列mtss90保守性与特异性均良好。其保守存在于所有被检MTB株中，除与田鼠分枝杆菌有交叉外，特异性良好。与传统鉴定结果相比，符合率为99.1％(233/235)，两例不相符的临床分离株经测序及多指标联合鉴定，证实mtss90的鉴定结果正确。与核酸靶标16s rDNA（分枝杆菌属特征性靶标）、IS6110(结核分枝杆菌复合体特征性靶标)符合率可达100％;与mtp40（MTB的特征性靶标）的符合率为99.6％(234/235)，唯一不相符的临床分离株为mtp40缺失的MTB株。成功建立基于mtss90的实时荧光定量PCR方法。　　结论：　　通过生物信息学软件筛选出的MTB特征性序列可作为鉴定MTB的新型分子靶标，可单独或与其它指标联合用于结核病的快速诊断与鉴定。