动物养殖过程中会产生大量真菌气溶胶,危害动物和人类健康,给养殖业带来巨大的经济损失。动物圈舍气载真菌的浓度、组成及危害程度与动物圈舍的结构和饲养方式有着密切关系。本研究选取山西省常见的封闭式和半封闭式羊舍,并在封闭式羊舍中选取高床平养和地面平养2种饲养方式的羊舍作为研究对象,使用Andersen-6级空气微生物采样器和AGI-30采样器,以孟加拉红培养基和超纯水为采样基质,自2016年7月至2017年12月分别采集以上4种羊舍内外环境的春、夏、秋、冬4个季节的空气样本,同时采集羊舍饲料、粪土样本,测定和分析了不同类型羊舍真菌气溶胶的浓度、组成、粒径分布等特点；应用ERIC-PCR技术,比较不同类型羊舍环境真菌菌群结构的整体差异,探索羊舍空气真菌的来源和变化规律,以期为羊舍的选择及环境控制提供依据。结果表明:1.封闭式羊舍气载真菌浓度春、秋两季显著高于半封闭式羊舍,两种结构羊舍气载真菌在Andersen-6级采样器上呈正态分布,主要分布在采样器的Ⅲ-Ⅴ级(1.1-4.7μm),羊舍气载真菌的CMD值相差较小,但随季节变化较大;封闭式羊舍中到达呼吸道深部的真菌气溶胶粒子数高于半封闭式羊舍,对人和动物健康的威胁更大。2.高床平养羊舍内气载真菌浓度春、夏季显著高于地面平养羊舍,冬季显著低于地面羊舍；羊舍气载真菌主要分布在采样器的Ⅲ-Ⅴ级(1.1μm~4.7μm)；高床羊舍气载真菌的CMD值低于地面平养羊舍；高床平养舍夏季可到达肺部深处的真菌气溶胶粒子数最高为地面平养羊舍的2.35倍。3.羊舍气载真菌与外环境有部分共同的优势菌属,并因季节而不同。封闭式羊舍春冬季优势菌为 Penicillium spp.,夏季为 Alternaria spp.,秋季为 Cladosporium spp.；半封闭式羊舍夏季优势菌为Cladosporium spp.,其他季节优势菌为Penicillium spp.:外环境气载真菌四季优势菌的分布与封闭式羊舍一致。高床平养羊舍春季气载真菌的优势菌为Aspergillusspp.,其他季节优势菌为Penicillium spp.；地面平养羊舍夏季优势菌为Clacdosporiu spp.,其他季节优势菌为Penicillum spp.；外环境春、夏、秋、冬四季优势菌分别为 Penicillium spp.、Yeast、Mycelia Sterilia、Penicillium spp。饲料、粪土中的优势菌为Yeast。4.ERIC-PCR指纹图谱表明半封闭式羊舍气载真菌菌群比封闭式羊舍丰富,高床平养羊舍比地面平养羊舍丰富;Shannon-Wiener多样性指数和Simpson优势度指数统计结果显示不同结构、饲养方式的羊舍气载真菌菌群多样性分布差异不显著,但聚类树状图中多数样本按照羊舍结构、饲养方式形成分枝,相同季节样本聚集形成小分支,说明羊舍真菌菌群分布受结构、饲养方式的影响,且菌群变化具有季节性。5.半封闭式羊舍舍内与外环境气载真菌相似系数比封闭式羊舍内外环境真菌相似系数高,封闭式羊舍和半封闭式羊舍气载真菌与粪土真菌的相似系数较高；高床平养羊舍气载真菌与基质真菌菌群的相似系数高于地面平养羊舍，其中高床平养羊舍气载真菌与饲料的相似系数较高,地面平养羊舍气载真菌与粪土真菌的相似系数较高。