三峡库区是国家统筹城乡发展改革实验区，也是中央对重庆市“314”总体部署实施的重点区域，集大城市、大农村、大库区、大山区和移民区为一体，面临土地超载严重，二、三产业空虚，经济贫困落后，移民安稳致富等问题。本文借鉴现有文献关于农村土地流转相关方面的研究成果，采取理论分析与实地调研、定性分析与定量分析、专家咨询与深度访谈相结合的方法，对当前三峡库区农村土地流转存在的一系列问题题进行了梳理，找出核心问题和深层原因，并在此基础上分析解决方法，即确定农村土地流转的优化模式及运行机制，从而实现农村土地流转的健康发展。首先构建数理模型，理论上分析是什么因素阻碍三峡库区土地流转的发生与发展，然后借助实地农户调查数据进行实证计量分析，最后剖析制约三峡库区农户土地流转不畅的问题所在，为土地使用权的灵活使用打开一条流转双方可有效对接的便捷通道。通过假设农户为“理性经济人”，将农户综合净收益分解为生产、流转和非农三项，以此构建统一的表征农户流转的理论决策模型，基于流转双方净收益最大目标求解模型，最后，从影响三项收益最大化的视角，理论解析库区农户土地流转影响因素的作用轨迹。研究结果显示：原承包土地面积、农业生产成本、农产品价格、农业生产收益安全系数和家庭拥有资本量共同影响农业生产的净收益，属流转双方作出流转决策行为的基础依据；单位面积土地流转年租金和流转年限共同控制土地流转净收益多少，属流转双方评判凭借土地使用权转移所可能获得净收益的根本指标，是有效流转发生“博弈”的关键；非农就业概率显著影响非农就业净收益，是拉动土地流转发生的最主要的外力，也是开启农户对土地依赖性松动的根本力量，属改变人地关系的外施驱动因素。在考虑农业生产的弱质性和非农就业的不稳定性前提下，库区土地流转双方对接受阻的困境在于双方决策行为均是想借助土地流转将所持资源最大限度地动员起来，以追求土地、资本、劳动力等要素整后的综合收益的最大化目标能否实现为基准。转出发生与非农就业概率的正相关和与家庭拥有资本量的负相关，以及转入发生与非农就业概率的负相关更具有政策含义，尤其后者政策安排要确保农业生产雇工的有效性。在理论分析的基础上，然后通过建立logistic回归模型进行实证分析各因素对农户土地流转决策影响，最后得出结论，影响农户土地流转决策的显著因子共有12个，分别是农户户主年龄、家庭总人口、总收入、非农收入比重、流转前耕种面积、水田面积比重、税收减免政策、土地调整次数、法律认知程度、地块灌排条件、地区二三产业比重和地区地形特征。各影响因素对农户土地流转的影响与影响因素作用机理的理论分析基本吻合，但也存在一定出入。家庭总收入、非农收入比重和总人口对农户土地流转的影响与理论分析正好相反，总收人越高的农户尽管存在转入土地的经济基础，但转入土地概率反而越小；非农收人越高的农户尽管非农生产依赖程度越大，但转入土地的概率和意愿反而越强；总人口越多的农户尽管存在更大的脱离农业生产的成本，但转入土地的意愿反而越小；法律认知程度越高的农户，土地转出意愿反而越弱，尽管法律上对土地流转给予诸多支持。因此，及时发现了解这些影响因素的变化，并进行合理引导，出台相应政策法规，对于适应农户土地流转决策优化具有重要作用。