烟酰胺腺嘌呤二核苷酸激酶活性调节的分子机制探索及其先导化合物发现

来源 :中国科学院大学(中国科学院上海药物研究所) | 被引量 : 0次 | 上传用户:bloneedu
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烟酰胺腺嘌呤二核苷酸激酶(Nicotinamide Adenine Dinucleotide Kinase,NADK)催化烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(Nicotinamide Adenine Dinucleotide,NAD+)磷酸化生成烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(Nicotinamide Adenine Dinucleotide Phosphate,NADP+),控制细胞内NADP+/NADPH的含量。与正常细胞相比,高度增殖的肿瘤细胞需要大量的NADP+/NADPH,用于核酸、蛋白质、脂质等生物大分子的快速合成以及中和过多的活性氧(Reactive Oxygen Species,ROS)。Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(Kirsten rats arcomaviral oncogene homolog,KRAS)激活突变是肿瘤中最为广泛存在的激活突变,尤其在肺癌、胰腺癌和结直肠癌中。研究表明,NADK敲低不影响正常细胞生长,也不影响KRAS野生型的肿瘤细胞的成瘤性或转化性生长。但是,敲低NADK的表达或抑制其酶活则可以显著降低KRAS激活突变的肿瘤细胞的成瘤性生长。这提示NADK参与由KRAS介导的肿瘤生长过程。因此,开发靶向NADK的小分子抑制剂有可能实现特异性杀伤KRAS激活突变的肿瘤细胞。但是,目前为止,KRAS调控NADK酶活的分子机制以及靶向NADK的小分子抑制剂还没有被报道。本课题通过蛋白质质谱、蛋白免疫共沉淀(Co-IP)、体外Pull down实验等方法,发现KRAS下游关键激酶细胞外调节蛋白激酶1/2(extracellular regulated protein kinase 1/2,ERK1/2)可以直接结合NADK蛋白;通过蛋白质修饰质谱、体外磷酸化和细胞内磷酸化实验发现ERK1/2激酶可以磷酸化NADK的第48位和50位的丝氨酸残基(NADK-S48/50)。进一步的体外和细胞内酶活性实验发现NADK-S48/50的磷酸化可以显著激活NADK酶活性。该研究结果揭示KRAS调节NADK酶活性和细胞内NADP+/NADPH水平的关键作用机制。同时,我们通过建立和优化基于NADK酶活的高通量筛选方法(Z factor为0.71),对实验室自建的天然产物化合物库进行筛选,发现一个NADK抑制剂(-)-表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG),其抑制活性IC50值为1.3±1.1μM。一维核磁共振(NMR)实验结果显示EGCG可以与NADK直接结合。表面等离子共振(Surface Plasmon Resonance,SPR)实验测定EGCG与NADK的结合亲和力Kd值为1.78±1.15μΜ。通过竞争性实验发现EGCG是一种非竞争性抑制剂,Ki=3.28±0.32μΜ。为了探究EGCG在NADK上的结合位点,我们进行了氢氘交换质谱(Hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry,HDX-MS)实验,结果显示EGCG结合在NADK的非底物结合位点。另外,结合模式预测和衍生物活性分析研究揭示了EGCG和NADK之间潜在的构效关系(Structure activity relationships,SAR)。此外,发现EGCG可以特异性抑制KRAS激活突变的肺癌细胞的增殖,而对KRAS野生型肺癌细胞增殖没有影响。综上所述,本课题以NADK为研究对象,首次发现NADK是ERK1/2激酶的底物蛋白,ERK1/2可以磷酸化NADK-S48/50激活其酶活性。我们构建高通量筛选平台并发现天然产物EGCG是NADK的非竞争性抑制剂。EGCG可以特异性抑制KRAS激活突变型肺癌细胞增殖,这为后续NADK靶向药物开发奠定良好的研究基础。
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