保障性安居工程是我国保障和改善民生的标志性工程，是“十二五”规划、“十三五”规划的重点工程。加快建设保障性安居工程对建设服务型政府、全面建设小康社会、构建和谐社会、共圆“中国梦”等具有重大意义。我国保障性安居工程的顺利实施，不仅需要国家的大力扶持，更需要全体社会的共同监督。跟踪审计作为一种具有中国特色、符合我国审计发展实际状况需要的新型全过程审计方式，为解决我国审计发展过程中的难题提供新思路。跟踪审计能够良好克服传统审计被动、滞后、低效率等缺陷，能够有效避免资金浪费，提高使用效率，能够及时铲除贪污腐败、行贿受贿的“温床”。本文是基于全国范围内对保障性安居工程实施跟踪审计的大背景下，从基本理论概念入手，阐述了保障性工程和跟踪审计的涵义与特点，总结了跟踪审计实施的主客体及我国相应制度安排，通过对比分析提出了开展跟踪审计的必要性，论述了跟踪审计的实施原则及事前、事中、事后三阶段具体审计流程与方法，针对保障性安居工程现状，从资金审计、工程质量审计及后续分配审计三方面重点探讨了审计实施方法。本文结合2011年至2013年全国保障性安居工程跟踪审计报告及部分地区、网络调查统计资料，运用大量实际数据表明我国现阶段存在政策落实不到位、挪用工程资金、工程质量不过关、工程进度滞后、违规销售保障性住房、住房分配暗箱操作、大量住房闲置、房屋后续服务差等一系列问题，究其原因主要集中在政府支持不够、政策制度不全、科学技术不强、社会监督不力等四个方面，并针对上述情况，通过实践工作的角度提出可以从改善融资模式、强化质量管理、改进运行机制、落实考核制度等四个方面解决实际发现的诸多问题，通过跟踪审计的角度提出可以从加强理论、健全规范、改进方法、完善体系等四个方面完善审计工作的监督作用，以期能够作为顺利开展后续审计工作的参考依据。本文研究价值在于：其一，通过查阅大量国内外相关文献资料，整合了保障性安居工程跟踪审计现有的理论知识，借鉴相关其它领域内容，形成一个多维度、跨学科理论体系，并且在一定程度上弥补了我国理论文献缺乏实例的缺陷，丰富完善了我国跟踪审计理论。其二，本着理论与实践相结合的原则，分析了我国近三年保障性安居工程的现状和问题，阐明了跟踪审计是保障性安居工程有保障能安居的有效途径，同时探索了跟踪审计实质性测试的重点和难点，提出了完善我国保障性安居工程及跟踪审计的对策和建议。