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结核病(TB)仍然是目前全球和我国严重的公共卫生问题之一。我国有近一半人口(约5.5亿人)感染了结核杆菌,全国现有肺结核病人451万,同时每年因结核病死亡约有13万人,是各种传染病和寄生虫病死亡总和的2倍。耐药结核病,尤其是耐多药(MDR)结核病和广泛耐药(XDR)结核病的出现更是给全球结核病控制带来了严重的挑战,已成为结核病研究和控制领域亟待解决的难点之一。本研究首先回顾性分析了2000-2006年上海市耐药监测数据,对结核病人的耐药谱、耐药流行趋势和特点进行了分析,并探讨了耐药结核病的危险因素。同时,在流行病学分析的基础上,利用基因分型技术深入探讨了复发患者耐药产生的原因。此外,本研究对上海市结核分枝杆菌流行菌株的embB基因306位点突变情况与耐药表型进行了分析,进一步揭示了结核分枝杆菌耐药的分子机制。流行病学资料表明,2000-2006年,上海市有药物敏感性检测结果的8419例肺结核患者中,耐药率为16.6%,耐多药率为4.0%,耐INH率为10.3%,耐RFP率为5.6%,耐SM率为11.1%,耐EMB率为1.2%。上海市结核病耐药率处于全球较高水平,控制形势仍然严峻。2000-2003年,上海市结核病耐药率(p=0.01)以及耐多药率(p=0.005)显著上升。加强结核病防治措施后,2004-2006年,耐多药率显著下降28.8%(p=0.04),耐药率(p=0.68)保持稳定,并呈现下降趋势,提示结核病控制措施的完善和加强可有效防止耐药结核病的产生和传播。此外,72%(1016/1401)的耐药患者和60%(199/333)的耐多药患者为初治患者,无既往抗结核治疗史报告。提示耐药菌株的近期传播可能是耐药病人产生的主要原因。与耐药及耐多药相关的独立危险因素包括复治、流动人口、30-59岁年龄组、居住于市区。为了深入探讨耐药产生的原因,本研究以1999-2004年上海市复发患者为例,利用结核分枝杆菌基因型分型技术对耐药患者前后二次发病菌株的基因型进行了分析。在18例复发耐药病例中,13例(72.2%)患者两次发病菌株的MIRU基因型都发生了改变,只有5例患者前后两次发病菌株的MIRU基因型没有改变。说明大多数复发耐药患者并不是由前次发病的菌株所致,而是感染了其它耐药菌株所致,属于原发性耐药,这一结果提示原发性耐药在耐药结核病产生中起着重要作用,同时提示耐药结核分枝杆菌的近期外源性感染较为严重。今后要加强传染源的控制,切断传播途径。乙胺丁醇(EMB)是目前普遍使用的一线抗结核药物之一。有研究表明EMB耐药菌株往往同时耐其它药物。为了观察这种现象是否与不同地区的流行菌株相关,本研究对上海市1999-2005年收集的结核分枝杆菌的EMB耐药表型进行分析。结果表明,在耐EMB的104株结核分枝杆菌菌株中,单耐EMB的菌株仅占2.9%,97.1%都同时耐其它药物。而且,耐EMB菌株随着耐其它药物种类的增加,菌株数也逐步增加,提示耐EMB与耐其它药物存在相关性。为了进一步探讨embB306位点突变和结核分枝杆菌耐药之间的相关性,本研究分析了162株流行菌株的embB306位点突变情况。结果发现,54株全敏感菌株没有embB306位点突变,而在耐任何药物的菌株中28.7%可检测到embB306位点突变(p＜0.0001)。embB306位点突变不仅可在EMB耐药菌株中检测到,也可发生在EMB敏感菌株中。而且,随着菌株耐不同药物数量的增加,embB306位点突变也随之增高,表明embB306位点突变与结核分枝杆菌耐任何药物存在相关性。另外,MDR菌株(35.3%)embB306位点的突变率显著高于非MDR菌株(7.4%,p＜0.0001)。该位点用于MDR-TB的快速诊断,灵敏度为35.3%,特异度为92.6%,阳性预测值为77.4%,阴性预测值为66.4%,提示该位点可以作为MDR-TB和XDR-TB快速检测的一个候选分子标记。