Regulome-SNP与原发性肝癌易感性的相关研究

来源 :延边大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:szRUIZHIZI
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研究背景:原发性肝癌(primary hepatic cancer,PHC)是一种常见的恶性肿瘤,其死亡病例数在世界范围内位居癌症死亡总病例数的第三位。研究发现PHC的发生可能与多种遗传因素、病毒和环境因素有关,而慢性肝炎和肝硬化的发生不仅与PHC高度相关,同时也限制了手术切除的可行性。然而,传统的肝癌治疗方法都有其局限性,且肝癌发生的分子机制尚不清楚,因此长期无病生存的唯一机会是在出现症状前进行早期诊断和一级预防。为减轻我国肝癌的患病负担,PHC的预防及早期诊疗已成为当下研究的重点。单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)是由染色体上的单个核苷酸(A/C/T/G)发生变异而引起的一种DNA序列多态性。SNPs的变异包括核苷酸的插入、缺失或置换。碱基的变异可以通过诱导蛋白质的组装结构或功能来影响基因的转录调控。SNP不仅是一种遗传标记物,它也可以通过调控基因表达进而影响个体对疾病的易感性和预后。研究证明,编码区的SNP与多种恶性肿瘤有关,且参与肝癌的发生、发展和转移的过程。越来越多的证据表明,SNP可以为PHC的临床结果预测及治疗方式的选择提供最为精确和有效的信息,从而改善患者预后。研究目的:寻找PHC易感性相关SNP,以揭示SNP与PHC的相关关系,从而为早期筛选PHC高危人群及PHC的一级预防提供理论依据。材料和方法:本研究于2011年6月至2017年8月在延边大学附属医院及延边肿瘤医院采集了 599例PHC患者信息,同期随机筛选599名健康的体检者。采集患者及健康人群5毫升的静脉血并存储于-80℃冰箱,利用核酸提取仪从白细胞中提取DNA并通过送检进行基因分型,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)方法对基因分型结果进行核对,筛选与PHC易感性显著相关的SNP。结果:1、与对照组相比,PHC与饮酒(P<0.001)、肝炎病史(P<.001)、肝硬化(P<0.001)显著相关,而与吸烟无关(P=0.133)。2、x2检验发现,SHC1-rs11264233、PPP2R1A-rs12461478、SDHC-rs16832883 和 SKI-rs731031 的基因型在病例组与对照组之间的分布有显著性差异(P=0.021,P=0.009,P<0.001,P<0.001)其等位基因在两组之间的分布也有显著性差异(P=0.014,P=0.019,P<0.001,P<0.001)。3、Logistic回归分析显示,SHC1-rs11264233 中的 AA 基因型(OR=1.531),PPP2R1A-rs12461478 中的 TT 基因型(OR=2.000),SDHC-rs16832883 中的 GG 基因型(OR=2.743)以及SKI-rs731031 中的CC基因型(OR=1.723)是PHC发生的风险基因型。4、联合基因型分析发现,随着风险基因型数量的增加,PHC的患病风险也随之增加(Ptrend<0.001)。结论:该研究首次发现 SHC1-rsl1264233,PPP2R1A-rs12461478,SDHC-rs16832883和SKI-rs731031可能为PHC易感性相关SNP。其意义在于为早期筛选原发性肝癌高危人群、合理实施一级预防以及早期临床干预等提供理论依据。
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