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全基因组关联研究(GWASs)已被成功鉴定了与人类、动物和植物复杂性状相关联的数以千计的遗传变异。少数的GWAS结果则能够完全确定影响复杂性状的所有遗传因素,而这些遗传因素是由多种遗传和环境因素相结合引起的。但使用当前的分析技术大都存在遗传力丢失(missing heritability)即解释能力低下的窘境。通常,GWAS方法依赖混合模型进行群体结构校正,以避免性状与遗传标记之间的虚假关联。而多数单位点分析难于应对复杂性状多基因共同协同作用(包括上位性)的本质。因此,进一步研究基因相互作用可能有助